一种与燕麦小穗数性状相关的分子标记及其应用

本发明属于分子遗传学，具体涉及一种与燕麦小穗数性状相关的分子标记及其应用。

背景技术：

1、燕麦（avena sativa.l）是一种禾本科粮饲兼用型作物，广泛分布于20-40纬度的狭长地带。燕麦中富含蛋白质、脂类、维生素、矿物质、可溶性膳食纤维和各种生物活性成分，由其籽粒制成的产品氨基酸组成平衡，易于人体吸收；不饱和脂肪算含量高，具有调节血脂、提高机体免疫力等功能；可溶性膳食纤维b-葡聚糖含量高，在降胆固醇、调节血糖、改善肠道菌群等方面具有重要作用；此外，燕麦产品中富含的矿物质、酚类物质、植酸、生物碱等物质具有抗氧化、预防动脉硬化等功效。随着健康饮食的理念逐渐深入，燕麦的研究越来越受到重视。

2、燕麦小穗数是燕麦籽实产量的重要构成因子，小穗数与籽粒产量间存在显著的正相关性，其相关系数可达0.67，提高燕麦小穗数对于提高籽实产量至关重要。因此，高小穗数育种是燕麦育种的重要目标。然而，杂交后代在低世代存在性状分离，因此传统育种只在高世代后代材料中对目标性状进行选择，严重滞后了目标性状稳定的进程。而利用目标性状关联分子标记在低世代材料中对目标性状进行选择，辅助以快速加代技术，可促使目标性状快速稳定，加快目标品种的育成速度。然而，燕麦基因组庞大复杂，关键基因及分子标记发掘困难，基于现代生物技术的分子标记辅助选择育种技术在燕麦育种中应用较少，一定程度上阻碍了我国燕麦育种的发展。

3、基于以上需求，发明一种与燕麦小穗数性状相关的分子标记以解决杂交后代的低世代材料的快速选择问题，在分子遗传学技术领域中具有重大意义。

技术实现思路

1、本发明首先提供了燕麦基因组中分子标记或用于检测燕麦基因组中分子标记的物质在鉴定或辅助鉴定待燕麦小穗数性状中的应用；

2、所述分子标记为snp，所述snp位点在燕麦参考基因组sang v1.1中的物理位置为7c-43465750；所述snp位点处的核苷酸为g/a。

3、在某些实施例中，所述物质为kasp引物或试剂盒。

4、在某些实施例中，所述kasp引物序列如seq id no.13-seq id no.15所示。

5、本发明还提供用于鉴定或辅助鉴定燕麦小穗数性状的kasp引物，所述引物序列如seq id no.13-seq id no.15所示。

6、在某些实施例中，所述引物还包含“fam”及“hex”荧光序列标签。

7、本发明还提供用于鉴定或辅助鉴定燕麦小穗数性状的试剂盒，所述试剂盒中含有上述的kasp引物。

8、本发明还提供上述的kasp引物或上述的试剂盒在如下任一中的应用：

9、(a1)鉴定或辅助鉴定燕麦小穗数性状；

10、(a2)鉴定或辅助鉴定燕麦种质资源；

11、(a3)燕麦的育种。

12、本发明还提供一种鉴定或辅助鉴定燕麦小穗数性状的方法，包括检测待测上述的snp位点的步骤。

13、本发明最后提供上述的方法在如下任一中的应用：

14、(a1)鉴定或辅助鉴定燕麦小穗数性状；

15、(a2)鉴定或辅助鉴定燕麦种质资源；

16、(a3)燕麦的育种。

17、本发明与现有技术相比，至少具有如下有益效果：

18、本发明发现了一个与燕麦小穗数性状相关的分子标记，其能够作为有效的分子标记应用于燕麦多小穗数分子标记辅助选择育种当中，对于快速且精准的筛选杂交后代中的纯合高小穗数植株具有较高的准确性，能够显著提升优质燕麦的育种效率；为解决杂交后代的低世代材料的快速选择问题，在分子遗传学技术领域中具有重大意义。

技术特征：

1.燕麦基因组中分子标记或用于检测燕麦基因组中分子标记的物质在鉴定或辅助鉴定待燕麦小穗数性状中的应用；

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述物质为kasp引物或试剂盒。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：所述kasp引物序列如seq id no.13-seqid no.15所示。

4.用于鉴定或辅助鉴定燕麦小穗数性状的kasp引物，其特征在于：所述引物序列如seqid no.13-seq id no.15所示。

5.根据权利要求4所述的引物，其特征在于：所述引物还包含“fam”及“hex”荧光序列标签。

6.用于鉴定或辅助鉴定燕麦小穗数性状的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒中含有权利要求4-5任一所述的kasp引物。

7.权利要求4-5任一所述的kasp引物或权利要求6所述的试剂盒在如下任一中的应用：

8.一种鉴定或辅助鉴定燕麦小穗数性状的方法，其特征在于：包括检测待测权利要求1中所述的snp位点的步骤。

9.权利要求8所述的方法在如下任一中的应用：

技术总结
本发明属于分子遗传学技术领域，具体涉及一种与燕麦小穗数性状相关的分子标记及其应用，所述分子标记为SNP，所述SNP位点在燕麦参考基因组SangV1.1中的物理位置为7C‑43465750；所述SNP位点处的核苷酸为G/A；本发明发现了一个与燕麦小穗数性状相关的分子标记，其能够作为有效的分子标记应用于燕麦多小穗数分子标记辅助选择育种当中，对于快速且精准的筛选杂交后代中的纯合高小穗数植株具有较高的准确性，能够显著提升优质燕麦的育种效率；为解决杂交后代的低世代材料的快速选择问题，在分子遗传学技术领域中具有重大意义。

技术研发人员：马琳,王学敏,温红雨,蒋庆雪,张志鹏,崔闫红
受保护的技术使用者：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
技术研发日：
技术公布日：2024/9/23