背景技术:
1、通过rna诱导的基因沉默进行的基因抑制提供了几种控制水平:转录失活、小干扰rna(sirna)诱导的mrna降解和sirna诱导的转录弱化。在一些情况下,rna干扰(rnai)对多细胞分裂提供持久的影响。因此,rnai代表了用于药物靶标验证、基因功能分析、途径分析和疾病疗法的可行方法。
技术实现思路
1、在某些实施方案中,本文公开了包含与多核酸分子和聚合物缀合的结合部分的组合物和药物制剂。在一些实施方案中,本文还描述了包括利用组合物或药物制剂用于治疗疾病或病况(例如,癌症)的方法,所述组合物或药物制剂包含与多核酸分子和聚合物缀合的结合部分。
2、在某些实施方案中,本文公开了式(i)的分子:
3、a-x-b-y-c
4、式i
5、其中,
6、a为结合部分;
7、b为多核苷酸;
8、c为聚合物;
9、x为键或第一连接体;以及
10、y为键或第二连接体;并且
11、其中所述多核苷酸包含至少一个2’修饰的核苷酸、至少一个修饰的核苷酸间键或至少一个反向脱碱基部分。
12、在一些实施方案中,所述至少一个2’修饰的核苷酸包括2’-o-甲基、2’-o-甲氧基乙基(2’-o-moe)、2’-o-氨基丙基、2’-脱氧、t-脱氧-2’-氟代、2’-o-氨基丙基(2’-o-ap)、2’-o-二甲基氨基乙基(2’-o-dmaoe)、2’-o-二甲基氨基丙基(2’-o-dmap)、t-o-二甲基氨基乙氧基乙基(2’-o-dmaeoe)或2’-o-n-甲基乙酰氨基(2’-o-nma)修饰的核苷酸。在一些实施方案中,所述至少一个2’修饰的核苷酸包括锁定核酸(lna)或乙烯核酸(ena)。在一些实施方案中,所述至少一个修饰的核苷酸间键包括硫代磷酸酯键或二硫代磷酸酯键。在一些实施方案中,所述至少一个反向脱碱基部分在至少一个末端。
13、在一些实施方案中,所述多核苷酸包含单链。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含两条或多条链。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含第一多核苷酸和与所述第一多核苷酸杂交的第二多核苷酸,以形成双链多核酸分子。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含至少一种修饰。
14、在一些实施方案中,所述第一多核苷酸和所述第二多核苷酸为rna分子。在一些实施方案中,所述第一多核苷酸和所述第二多核苷酸为sirna分子。
15、在一些实施方案中,所述第一多核苷酸包含与seq id no:16-75、452-1955、1956-1962、1967-2002、2013-2032、2082-2109或2117具有至少60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列。在一些实施方案中,所述第一多核苷酸由选自seq id no:16-75、452-1955、1956-1962、1967-2002、2013-2032、2082-2109或2117的序列组成。
16、在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含与seq id no:16-75、452-1955、1956-1962、1967-2002、2013-2032、2082-2109或2117具有至少60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸由选自seq id no:16-75、452-1955、1956-1962、1967-2002、2013-2032、2082-2109或2117的序列组成。
17、在一些实施方案中,x和y独立地为键或非聚合物连接体基团。在一些实施方案中,x为键。在一些实施方案中,x为c1-c6烷基基团。在一些实施方案中,y为c1-c6烷基基团。在一些实施方案中,x为同双官能连接体或异双官能连接体,任选地与c1-c6烷基基团缀合。在一些实施方案中,y为同双官能连接体或异双官能连接体。
18、在一些实施方案中,所述结合部分为抗体或其结合片段。在一些实施方案中,所述抗体或其结合片段包括人源化抗体或其结合片段、嵌合抗体或其结合片段、单克隆抗体或其结合片段、单价fab’、二价fab2、单链可变片段(scfv)、双抗体、微抗体、纳米抗体、单域抗体(sdab)、或者骆驼科动物抗体或其结合片段。在一些实施方案中,所述抗体或其结合片段为抗egfr抗体或其结合片段。
19、在一些实施方案中,c为聚乙二醇。在一些实施方案中,c具有约5000da的分子量。
20、在一些实施方案中,a-x与b的5’端缀合,并且y-c与b的3’端缀合。在一些实施方案中,y-c与b的5’端缀合,并且a-x与b的3’端缀合。在一些实施方案中,a-x、y-c或其组合与核苷酸间连接基团缀合。
21、在一些实施方案中,所述分子进一步包含d。在一些实施方案中,d与c或a缀合。
22、在一些实施方案中,d根据式(ii)与式(i)的分子缀合:
23、(a-x-b-y-cn)-l-d
24、式ii
25、其中,
26、a为结合部分;
27、b为多核苷酸;
28、c为聚合物;
29、x为键或第一连接体;
30、y为键或第二连接体;
31、l为键或第三连接体;
32、d为内体溶解(endosomolytic)部分;以及
33、n为0与1之间的整数;并且
34、其中所述多核苷酸包含至少一个2’修饰的核苷酸、至少一个修饰的核苷酸间键或至少一个反向脱碱基部分;并且d缀合在a、b或c上的任何地方。
35、在一些实施方案中,d为inf7或蜂毒肽。
36、在一些实施方案中,d为内体溶解聚合物。
37、在一些实施方案中,l为c1-c6烷基基团。在一些实施方案中,l为同双官能连接体或异双官能连接体。
38、在一些实施方案中,所述分子进一步包含至少第二结合部分a。在一些实施方案中,所述至少第二结合部分a与a、b或c缀合。在一些实施方案中,所述至少第二结合部分a为胆固醇。
39、在一些实施方案中,所述分子进一步包含至少另外的多核苷酸b。在一些实施方案中,所述至少另外的多核苷酸b与a、b或c缀合。
40、在一些实施方案中,所述分子进一步包含至少另外的聚合物c。在一些实施方案中,所述至少另外的聚合物c与a、b或c缀合。
41、在某些实施方案中,本文公开了式(i)的分子:a-x-b-y-c(式i),其中a为抗体或其结合片段;b为多核苷酸;c为聚合物;x为键或第一非聚合物连接体;以及y为键或第二连接体;其中所述多核苷酸包含至少一个2’修饰的核苷酸、至少一个修饰的核苷酸间键或至少一个反向脱碱基部分;并且其中a和c不在相同末端连接至b。在一些实施方案中,所述至少一个2’修饰的核苷酸包括2’-o-甲基、2’-o-甲氧基乙基(2’-o-moe)、2’-o-氨基丙基、2’-脱氧、t-脱氧-2’-氟代、2’-o-氨基丙基(2’-o-ap)、2’-o-二甲基氨基乙基(2’-o-dmaoe)、2’-o-二甲基氨基丙基(2’-o-dmap)、t-o-二甲基氨基乙氧基乙基(2’-o-dmaeoe)或2’-o-n-甲基乙酰氨基(2’-o-nma)修饰的核苷酸。在一些实施方案中,所述至少一个2’修饰的核苷酸包括锁定核酸(lna)或乙烯核酸(ena)。在一些实施方案中,所述至少一个修饰的核苷酸间键包括硫代磷酸酯键或二硫代磷酸酯键。在一些实施方案中,所述至少一个反向脱碱基部分在至少一个末端。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含单链。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含第一多核苷酸和与所述第一多核苷酸杂交的第二多核苷酸,以形成双链多核酸分子。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含至少一种修饰。在一些实施方案中,所述第一多核苷酸和所述第二多核苷酸为rna分子。在一些实施方案中,所述第一多核苷酸包含与seq id no:16-75、452-1955、1956-1962、1967-2002、2013-2032、2082-2109或2117具有至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含与seq id no:16-75、452-1955、1956-1962、1967-2002、2013-2032、2082-2109或2117具有至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列。在一些实施方案中,y为非聚合物连接体基团。在一些实施方案中,x为键。在一些实施方案中,x为c1-c6烷基基团。在一些实施方案中,y为c1-c6烷基基团。在一些实施方案中,x为同双官能连接体或异双官能连接体,任选地与c1-c6烷基基团缀合。在一些实施方案中,y为同双官能连接体或异双官能连接体。在一些实施方案中,所述抗体或其结合片段包括人源化抗体或其结合片段、嵌合抗体或其结合片段、单克隆抗体或其结合片段、单价fab’、二价fab2、单链可变片段(scfv)、双抗体、微抗体、纳米抗体、单域抗体(sdab)、或者骆驼科动物抗体或其结合片段。在一些实施方案中,c为聚乙二醇。在一些实施方案中,c具有约1000da、2000da或5000da的分子量。在一些实施方案中,a-x与b的5’端缀合,并且y-c与b的3’端缀合。在一些实施方案中,y-c与b的5’端缀合,并且a-x与b的3’端缀合。在一些实施方案中,所述分子进一步包含d。在一些实施方案中,d与c或a缀合。在一些实施方案中,d根据式(ii)与式(i)的分子缀合:(a-x-b-y-cc)-l-d(式ii),其中a为抗体或其结合片段;b为多核苷酸;c为聚合物;x为键或第一非聚合物连接体;y为键或第二连接体;l为键或第三连接体;d为内体溶解部分;以及n为0与1之间的整数;其中所述多核苷酸包含至少一个2’修饰的核苷酸、至少一个修饰的核苷酸间键或至少一个反向脱碱基部分;其中a和c不在相同末端连接至b;并且其中d缀合在a或c上的任何地方或者b的末端。在一些实施方案中,d为inf7或蜂毒肽。在一些实施方案中,d为内体溶解聚合物。在一些实施方案中,l为c1-c6烷基基团。在一些实施方案中,l为同双官能连接体或异双官能连接体。在一些实施方案中,所述分子进一步包含至少第二结合部分。在一些实施方案中,所述至少第二结合部分与a、b或c缀合。在一些实施方案中,所述至少第二结合部分为胆固醇。在一些实施方案中,所述分子进一步包含至少另外的多核苷酸b。在一些实施方案中,所述至少另外的多核苷酸b与a、b或c缀合。在一些实施方案中,所述分子进一步包含至少另外的聚合物c。在一些实施方案中,所述至少另外的聚合物c与a、b或c缀合。
42、在某些实施方案中,本文公开了包含上述分子和药学上可接受的赋形剂的药物组合物。在一些实施方案中,所述药物组合物被配制为纳米颗粒制剂。在一些实施方案中,所述药物组合物被配制用于肠胃外、口服、鼻内、经颊、直肠或经皮给药。
43、在某些实施方案中,本文公开了治疗有需要的患者中的疾病或病症的方法,包括向所述患者施用包含上述分子的组合物。在一些实施方案中,所述疾病或病症为癌症。在一些实施方案中,所述癌症为实体瘤。在一些实施方案中,所述癌症为恶性血液病。在一些实施方案中,所述癌症包括kras相关癌症、egfr相关癌症、ar相关癌症、β-连环蛋白相关癌症、pik3c相关癌症或myc相关癌症。在一些实施方案中,所述癌症包括膀胱癌、乳腺癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、食管癌、多形性成胶质细胞瘤、头颈癌、肾癌、肺癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌或甲状腺癌。在一些实施方案中,所述癌症包括急性髓样白血病、cll、dlbcl或多发性骨髓瘤。在一些实施方案中,所述方法为免疫肿瘤学疗法。
44、在某些实施方案中,本文公开了抑制患者原代细胞中的靶基因表达的方法,包括将上述分子施用于所述原代细胞。在一些实施方案中,所述方法为体内方法。在一些实施方案中,所述患者为人类。
45、在某些实施方案中,本文公开了包含上述分子的免疫肿瘤学疗法,用于治疗有需要的患者中的疾病或病症。
46、在某些实施方案中,本文公开了包含上述分子的药剂盒。
1.一种式(i)的分子:
2.如权利要求1所述的分子,其中所述至少一个2’修饰的核苷酸包括2’-o-甲基、2’-o-甲氧基乙基(2’-o-moe)、2’-o-氨基丙基、2’-脱氧、2’-脱氧-2’-氟代、2’-o-氨基丙基(2’-o-ap)、2’-o-二甲基氨基乙基(2’-o-dmaoe)、2’-o-二甲基氨基丙基(2’-o-dmap)、2’-o-二甲基氨基乙氧基乙基(2’-o-dmaeoe)或2’-o-n-甲基乙酰氨基(2’-o-nma)修饰的核苷酸。
3.如权利要求1所述的分子,其中所述至少一个2’修饰的核苷酸包括锁定核酸(lna)或乙烯核酸(ena)。
4.如权利要求1所述的分子,其中所述至少一个修饰的核苷酸间键包括硫代磷酸酯键或二硫代磷酸酯键。
5.如权利要求1所述的分子,其中所述至少一个反向脱碱基部分在至少一个末端。
6.如权利要求1所述的分子,其中所述过客链和指导链包含至少一个修饰。
7.如权利要求1所述的分子,其中所述过客链和所述指导链为rna分子。
8.如权利要求1所述的分子,其中所述过客链包含与seq id no:16-75、452-1955、1956-1962、1967-2002、2013-2032、2082-2109或2117具有至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列。
9.如权利要求1所述的分子,其中所述指导链包含与seq id no:16-75、452-1955、1956-1962、1967-2002、2013-2032、2082-2109或2117具有至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列同一性的序列。
10.如权利要求1所述的分子,其中x1和x2独立地为键。