本发明涉及医学诊断,尤其涉及一种grin2b基因突变体、突变体蛋白及应用。
背景技术:
1、mrd6型智力障碍 (mim 613970)是一种常染色体显性遗传性疾病。智力障碍或全面发育迟缓是一大类具有高度临床和遗传异质性的神经发育障碍性疾病,如共患孤独症谱系障碍、注意缺陷多动障碍等多种精神行为障碍,是全球儿童致残的主要原因之一,其病因复杂,涉及遗传等多种因素。grin2b基因(mim 138252)突变可导致常染色体显性遗传智力障碍6型和早期婴儿癫痫性脑病27型,所有患者均有轻至重度发育迟缓/智力障碍,还可表现为癫痫(51%)、孤独症谱系障碍和孤独症样行为(26%)、小头畸形、肌张力异常、运动障碍和皮质视觉损害等。
2、mrd6型智力障碍致病基因grin2b(mim 138252)定位于染色体12p13.1,基因全长444.8kb,包含13个外显子和12个内含子,编码含1484个氨基酸的甲基-d-天冬氨酸离子能谷氨酸受体亚基2b蛋白(glutamate ionotropic receptor nmda type subunit 2b,grin2b),在大脑皮质、海马和边缘前脑显著表达,包含1个氨基末端结构域、2个配体结合结构域(s1和s2)、4个跨膜结构域(m1~m4)和1个c末端结构域,致病性错义变体聚集在配体结合结构域s1和s2以及跨膜结构域m1~m4内或相邻区域;grin2b亚基表达在突触回路的可塑性、细胞迁移、分化和神经兴奋性传递形成过程中均起重要作用;在基因变异致病性中多为新发错义变异,较少为无义及移码变异,鉴于grin2b在控制nmda受体功能中的重要作用,grin2b亚基表达或功能变异的相关破坏可能会导致多种神经发育表型,导致mrd6型智力障碍的发生。
3、基因突变是导致mrd6型智力障碍发生发展的重要遗传基础,基因诊断是确诊mrd6型智力障碍的金标准。临床上需要针对不同突变建立相应的检测技术并用于明确病因和疾病诊断,研发检测方法,确定突变位点,助力mrd6型智力障碍基因突变的筛查和诊断,并为其药物筛选、药效评价及靶向治疗,具有重要意义。
技术实现思路
1、本发明的主要目的是提供一种grin2b基因突变体、突变体蛋白及应用,以解决mrd6型智力障碍的筛查和诊断的技术问题。
2、为实现上述目的,本申请提供了一种grin2b基因突变体,所述grin2b基因突变体相较于野生型grin2b基因,在所述野生型grin2b基因的第1824位碱基从g突变为t,所述野生型grin2b基因的登录号为nm_000834.5。
3、本申请还提供了一种grin2b突变体蛋白,所述grin2b突变体蛋白相较于野生型grin2b基因编码的蛋白,第608位氨基酸由亮氨酸突变为苯丙氨酸,所述野生型grin2b基因编码的蛋白的登录号为np_000825.2。
4、本申请还提供了一种上述的grin2b基因突变体作为检测靶点在制备mrd6型智力障碍检测试剂和/或在制备mrd6型智力障碍检测试剂盒中的应用,所述检测试剂和/或所述检测试剂盒包含阳性参考品,所述阳性参考品的序列如seq id no.7所示。
5、根据本申请的实施方式,所述检测试剂和/或所述检测试剂盒包括扩增引物和测序引物,所述扩增引物包括上游引物grin2b-1f和下游引物grin2b-1r;所述grin2b-1f包括如seq id no.1所示的核苷酸序列;所述grin2b-1r包括如seq id no.2所示的核苷酸序列;
6、所述测序引物包括上游引物grin2b-seq1f和下游引物grin2b-seq1r;所述上游引物grin2b-seq1f包括如seq id no.3所示的核苷酸序列;所述下游引物grin2b-seq1r包括如seq id no.4所示的核苷酸序列。
7、本发明的有益效果至少包括:
8、本发明提供了一种grin2b基因突变体,其相较于野生型grin2b基因,在所述野生型grin2b基因的第10号外显子的第1824位碱基从g突变为t。并且,本发明发现该grin2b基因突变体可以导致mrd6型智力障碍。
9、本发明提供的grin2b基因突变体丰富了mrd6型智力障碍的致病突变谱,通过检测受试者是否携带有上述grin2b基因突变体,能够筛查或诊断mrd6型智力障碍的致病基因突变携带者或患者,用于mrd6型智力障碍的遗传学诊断,以提供产前诊断、优生优育和治疗干预指导,为mrd6型智力障碍患者的治疗提供全新的理论依据,为治疗mrd6型智力障碍提供可能的药物靶点。
1.一种grin2b基因突变体,其特征在于,所述grin2b基因突变体相较于野生型grin2b基因,在所述野生型grin2b基因的第1824位碱基从g突变为t,所述野生型grin2b基因的登录号为nm_000834.5。
2.一种grin2b突变体蛋白,其特征在于,所述grin2b突变体蛋白相较于野生型grin2b基因编码的蛋白,第608位氨基酸由亮氨酸突变为苯丙氨酸,所述野生型grin2b基因编码的蛋白的登录号为np_000825.2。
3.一种如权利要求1所述的grin2b基因突变体作为检测靶点在制备mrd6型智力障碍检测试剂和/或在制备mrd6型智力障碍检测试剂盒中的应用,其特征在于,所述检测试剂和/或所述检测试剂盒包含阳性参考品,所述阳性参考品的序列如seq id no.7所示。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述检测试剂和/或所述检测试剂盒包括扩增引物和测序引物,所述扩增引物包括上游引物grin2b-1f和下游引物grin2b-1r;所述grin2b-1f包括如seq id no.1所示的核苷酸序列;所述grin2b-1r包括如seq id no.2所示的核苷酸序列;