用于治疗Rac-GTP酶介导的病症的化合物的制作方法
【专利说明】用于治疗Rac-GTP酶介导的病症的化合物 相关申请的夺叉引用
[0001] 本申请根据35U.S.C. § 119(e)要求2012年10月12日提交的美国临时专利申请 第61/713, 300号的优先权,其通过引用全文并入本文。
【背景技术】
[0002] Rho GTP酶包括小GTP酶Ras超家族的一个分支。它们在非常广泛的细胞过程包括 细胞迀移、细胞极化、膜运输、细胞骨架排布、增殖、凋亡和转录调控的调节上起到重要作用 (Etienne-Manneville, S 等人(2002). Nature 420,629-635· ;Boettner, B 等人·(2002). Gene 286,155-174.)。因此,Rho GTP酶已经牵涉于多种人类疾病的发病机制当中,包括心 血管疾病和癌(Hall, A. Science 1998, 279, 509-514 ;Wennerberg, K.,和 Der, C. J. (2004) J. Cell Sci. 117, 1301-1312. ;Ridley,A. J. (2006)Trends Cell Biol. 16, 522-529) 〇
[0003] Rho家族由22个基因组成,其编码人类中包括Rac的至少25个蛋白。Rho家族成 员接合GTP并且在失活的GDP结合状态和活性的GTP接合状态之间转换。在这样的情况下, Rho家族成员中很多在它们的活性状态表现出GTP酶活性。状态之间的这一循环由以下蛋 白调控:鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF) ;GTP酶激活蛋白(GAP);和作为负调节子的GDP解离 抑制剂(⑶I)(Malumbres, M 等人(2003)Nat. Rev. Cancer 3,459-465)。在静止期细胞中, Rho GTP酶主要以失活的GDP结合状态存在,而在生长刺激下,GEF被激活并随后刺激鸟嘌 呤核苷酸交换活性以促进活性的GTP结合Rho的形成。当结合GTP时,活性的活Rho GTP 酶与下游影响因子包括蛋白激酶和具有接头功能的其他蛋白相互作用。Rho GTP酶的内在 GTP水解功能之后被受Rho特异性GTP酶激活蛋白刺激。这使得Rho蛋白返回到它的失活 状态。Rac 特异性 RhoGEF 包括 Tiaml 和 Trio (Gao, Y 等人.(2004).?1"〇(3.恥七1.六。3(1.5(^· USA 101,7618-7623.)〇
[0004] Rac亚家族也与细胞转化相关,因此,Rho GTP酶的活性异常与癌有关。它们在 由Ras和其他癌基因引起的转化中起着至关重要的作用。Racl的Raclb剪接变体已显示 为组成性活性并转化;已经在乳腺癌和结肠癌中观察到其过表达(Qiu,R.G.等人.(1995) Nature 374, 457-459 ;Khosravi-Far, R.,等人(1995)Mol. Cell. Biol. 15, 6443-6453 ; Renshaw,M.W.等人(1996) Curr. Biol. 6, 76-83 ;Ferra;ro,D·,等人·(2006) Oncogene 25, 3689-3698)。已在,例如,脑肿瘤中注意到Rac3突变体,并且Racl和Rac3两者已经与 胶质母细胞瘤侵袭相关联(Hwang, S. L 等人(2005) J. Clin. Neurosci. 12, 571-574) 〇
[0005] 在恶性细胞中,异常的Rho GTP酶活性因 Rho GTP酶表达上的变化或者调控Rho 功能的GEF或GAP的功能受扰而产生。(Karnoub,A. E等人(2004). Breast Cancer Res. Treat. 84, 61-71)。由于Rho参与细胞转化的证据,Rho GTP酶是抗癌治疗的可能目标。抑 制GEF与它们各自的Rho家族成员相互作用的化合物将会是有用的Rho活性抑制剂并表现 出强大的特异性。到目前为止,小分子NSC23766( g卩,N6-[2-[[4-(二乙基氨基)-1-甲基 丁基]氨基]-6-甲基-4-嘧啶碱基]-2-甲基-4, 6-喹啉二胺三盐酸盐)已被确定为结合 Rac 1并通过Rac-特异性RhoGEF防止其激活。然而一些GEF活性没有被封闭。
[0006] 慢性骨髓性白血病(CML)是以费城染色体的产物p210-BCR-ABL的表达为表征的 恶性疾病。也被称为慢性粒细胞白血病(CGL)的是以骨髓中的主要髓样细胞不受调控的增 长和这些细胞在血液中的累积为表征的白血细胞的癌症。小鼠模型中Rho GTP酶Racl和 Rac2的缺乏已经显示出p210-BCR-ABL介导的细胞增殖的显著减少。这一证据强有力地表 明Rac是白血病治疗的潜在标靶。(E K Thoma等人,Leukemia 22, 898-904, May 2008) 〇
【发明内容】
[0007] 本公开基于对通过Rac-GTP酶蛋白上对接的分析鉴定的某些抗癌化合物的发现。 具体地,通过这一测定鉴定的这些化合物中的一个或多个在抑制癌细胞上表现出超高活性 并且对正常细胞的毒性低。
[0008] 在一个方面,本公开特征在于包括药学上可接受的载体和式(I)的化合物或其盐 (例如作为活性剂)的药物组合物:
[0009] 在式(I)中,Rp R2、R3、R4、R5、R6、R 7、馬和R9中的每一个独立地为H、C「C1Q烷基、 C2-Cltl烯基、C 2-c1(l炔基、C 3-c2(l环烷基、C 3-c2(l环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「c2(l杂环烯基、芳 基、杂芳基、卤代、〇Ra、SRa、C00Ra、OC (0) Ra、C (0) Ra、C (0) NRaRb、S (0) 2NRaRb或 NR aRb,其中艮和 Rb中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-C2Q环烷基、C 3-C2Q环烯基、 C1-C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基。
[0010] 参照式(I),本文描述的化合物的一个亚组是其中Rp R2、R3、R4、R5、R6、R 7、馬和R9分别是H、C1-Cltl烷基(例如CH 3)或NRaRb (例如N (CH3) 2)的那些。例如,在这些化合物中, R7可以是N(CH3) 2而R 2和R3中的每一个可以是CH3。这样的化合物的实例为
[0011] 在另一个方面,本公开特征在于包括药学上可接受的载体和式(II)的化合物或 其盐(例如作为活性剂)的药物组合物:
[0012] 在式(II)中,X是N或CH 5m RjPR5中的每一个独立地为HA1-Ciq烷基、 C2-Cltl烯基、C 2-c1(l炔基、C 3-c2(l环烷基、C 3-c2(l环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「c2(l杂环烯基、芳 基、杂芳基、卤代、〇Ra、SRa、COORa、OC (O) Ra、C (O) Ra、C (O) NRaRb、S (O) 2NRaRb或 NR aRb;R 6、R7、R8和R9中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-C2Q环烷基、C 3-(:2。环 烯基、C「C2Q杂环烷基、C「C2Q杂环烯基、芳基、杂芳基、卤代、0Ra、SR a、C00Ra、0C(0)Ra、C(O) Ra、C (0) NRaRb、S (0) 2NRaRb或NR aRb;或者R 6和R 7、&和R 8,或馬和R 9,与它们所连接的碳原子 一起,为芳基、杂芳基、C3-C2tl环烷基或C ^C2tl杂环烷基;R 3每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、 C2-Cltl烯基、C 2-C1(l炔基、C 3-C2(l环烷基、C 3-C2(l环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「C2(l杂环烯基、芳 基或杂芳基;并且Rb每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-C2Q环烷基、 C3-C2tl环烯基、C ^C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基。
[0013] 参照式(II),本文描述的化合物的一个亚组是其中X是N的那些。在这些化合物 中,R1、R2、R3、R4、R5、R 6、R7、馬和R 9中的每一个独立地可以是H或C ^Cltl烷基(例如CH 2CH3)。 例如,在这些化合物中,R7可以是CH 2CH3。这样的化合物的实例为
[0014] 参照式(II),本文描述的化合物的另一个亚组是其中X是CH的那些。在这些化合 物中,&和R7每一个,与它们所连的碳原子一起,可以是1,3-二氧戊环基团。这样的化合 物的实例是
[0015] 在另一个方面,本公开特征在于包括药学上可接受的载体和式(III)的化合物或 其盐(例如作为活性剂)的药物组合物:
[0016] 在式(III)中,RpHRjP R5中的每一个独立地为IC1-Cltl烷基、C2-Cjt基、 C2-Cltl炔基、C 3-c2(l环烷基、C 3-c2(l环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「c2(l杂环烯基、芳基、杂芳基、 卤代、ORa、SRa、COORa、OC (O) Ra、C (O) Ra、C (O) NRaRb、S (O) 2NRaRb或 NR aRb;或 R !和 R 2、馬和 R 3、 馬和R 4或R 4和R 5,与它们所连的碳原子一起,为芳基,杂芳基,C3-C2tl环烷基或C ^C2tl杂环 烷基;R6、R7、R8、R9、Rltl和R η中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、 C3-C2tl环烷基、C 3-C2Q环烯基、C ^C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基、杂芳基、卤代、OR a、SRa、 C00Ra、OC (0) Ra、C (0) Ra、C (0) NRaRb、S (0) 2NRaRb或 NR aRb;R a中的每一个独立地为 H、C ^C1。烷 基、C2-Cltl條基、C 2-C1(l炔基、C 3-C2(l环烷基、C 3-C2(l环條基、C「C2(l杂环烷基、C「C 2(l杂环條基、 芳基或杂芳基;并且Rb中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-Cjt基、C 2-C1(l炔基、C 3-C2Q环烷基、C3-C2tl环烯基、C ^C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基。
[0017] 参照式(III),本文描述的化合物的一个亚组是其中RjPR4中的每一个是1或1? 3和尺4,与它们所连的碳原子一起,为苯基或1,4-二氧六环基团的那些。在这些化合物中,Rp R2、R5、R6、R7、R8、R 9、Rltl和R η中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基(例如CH 3)或卤代(例如 C1)。例如,在这些化合物中,R1可以是H、Cl或CH3;R2可以是H或Cl ;并且Rltl和R11每一 个可以是CH3。这样的化合物的实例包括
[0018] 在另一个方面,本公开特征在于包括药学上可接受的载体和式(IV)的化合物或 其盐(例如作为活性剂)的药物组合物:
[0019] 在式(IV)中,R2、R3、&和R 5中的每一个独立地为H、C「C1Q烷基、C 2-C1(#基、 C2-Cltl炔基、c 3-c2(l环烷基、c 3-c2(l环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「c2(l杂环烯基、芳基、杂芳基、卤 代、0Ra、SRa、COORa OC (O) Ra、C (O) Ra、C (O) NRaRb、S (O) 2NRaRb或 NR aRb;或 R !和 R 2、馬和 R 3、R3和R4,或&和R 5,与它们所连的碳原子一起,为芳基、杂芳基、C3-C2tl环烷基或C ^C2tl杂环烷 基;R6、R7、R8、R9、R1(l、R 1JP R 12中的每一个独立地为 H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、 C3-C2tl环烷基、C 3-C2Q环烯基、C ^C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基、杂芳基、卤代、OR a、SRa、 C00Ra、OC (0) Ra、C (0) Ra、C (0) NRaRb、S (0) 2NRaRb或 NR aRb;R a中的每一个独立地为 H、C ^C1。烷 基、C2-Cltl條基、C 2-C1(l炔基、C 3-C2(l环烷基、C 3-C2(l环條基、C「C2(l杂环烷基、C「C 2(l杂环條基、 芳基或杂芳基;Rb中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1(l烯基、C 2-C1(l炔基、C 3-C2(l环烷 基、C3-C2tl环烯基、C ^C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基.
[0020] 参照式(IV),本文描述的化合物的一个亚组是其中Rp R2、R6、R7、R8、R9、R 1(l、Rjp R12中的每一个独立地为H、C「C1Q烷基(例如CH3)或卤代(例如F)的那些。例如,在这 些化合物中,Rltl可以是F ;R 7可以是CH 3;而且R 3、&和R 5中的每一个独立地可以为H或 S (O)2N(CH3)2;或者R 3和R4,与它们所连的碳原子一起,可以是1,3-二氧戊环基团;或者R4和R5,与它们所连的碳原子一起,可以是吡唑基。这样的化合物的实例包括
[0021] 在另一个方面,本公开特征在于包括药学上可接受的载体和式(V)的化合物或其 盐(例如作为活性剂)的药物组合物:
[0022] 在式(V)中,!^、!^、!^、!^、!^、!^、!^、馬為和^中的每一个独立地为瓜任选地由芳 基取代的C1-Cltl烷基、C 2-c1Q烯基、C 2-c1Q炔基、C 3-c2Q环烷基、C 3-c2Q环烯基、C「C2Q杂环烷基、 C1-C2tl杂环烯基、芳基、杂芳基、卤代、OR a、SRa、COORa、OC (O) Ra、C (O) Ra、C (O) NRaRb、S (O) 2NRaRb或NRaRb,其中RjP Rb中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-(:2。环 烷基、C3-C2tl环烯基、C ^C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基。
[0023] 参照式(V),本文描述的化合物的一个亚组是其中Rp R2、R3、R4、R5、R6、R 7、R8、馬和 Rltl中的每一个独立地为H、0H、Cl,或任选地由芳基取代的C ^Cltl烷基(例如由苯基取代的 甲基)的那些。例如,在这些化合物中,Rltl可以是由苯基取代的甲基和RJPR5中的每一个 独立地可以为H、Cl或0H。这些化合物的实例包括
[0024] 在另一个方面,本公开特征在于包括药学上可接受的载体和式(VI)的化合物或 其盐(例如作为活性剂)的药物组合物:
[0025] 在式(VI)中,R5中的每一个独立地为H、任选地由芳基取代的C1-C10烷基、C2-Cjt基、C 2-c1(l炔基、C 3-c2(l环烷基、C 3-c2(l环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「c2(l杂环烯 基、芳基、杂芳基、卤代、0艮、5艮、〇)01^、0(:(0)1^、(:(0)1^、(:(0)殿313、5(0) 2殿凡或顺义,其 中艮和R b中的每一个独立地为H、C ^Cici烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-C2Q环烷基、C 3-C20环烯基、C1-C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基。
[0026] 参照式(VI),本文描述的化合物的一个亚组是其中&、R2、R 3、&和R5中的每一个 独立地为H或任选地由芳基取代的C1-Cltl烷基(由苯基取代的甲基)的那些。例如,在这 些化合物中,R5可以是由苯基取代的甲基。这些化合物的实例为:
[0027] 术语"烷基"是指饱和的,直链或支链烃部分,例如-〇13或-CH(CH3)2。术语"烯 基"是指含有至少一个双键的直链或支链烃部分,例如-CH = CH-CH3。术语"炔基"是指含 有至少一个三键的直链或支链烃部分,例如-C = C-CH3。术语"环烷基"是指的饱和的环状 烃部分,例如环己基。术语"环烯基"是指含有至少一个双键的非芳香族的环状烃部分,例 如环己烯基。术语"杂环烷基"是指具有至少一个环杂原子(例如N、0或S)的饱和的环状 部分,例如4-四氢吡喃基。术语"杂环烯基"是指具有至少一个环杂原子(例如N、0或S) 和至少一个环双键的非芳香族的环状部分,例如吡喃基。术语"芳基"是指具有一个或多个 芳香族环的烃部分。芳基部分的实例包括苯基(Ph)、亚苯基、萘基、亚萘基、芘基、蒽基和菲 基。"杂芳基"是指具有含有至少一个杂原子(例如N、O或S)的一个或多个芳香族环的烃 部分。杂芳基部分的实例包括呋喃基、亚呋喃基、芴基、吡咯基、噻吩基、噁唑基、咪唑基、噻 唑基、吡啶基、嘧啶基、喹唑啉基、喹啉基、异喹啉基和吲哚基。
[0028] 在还有另一个方面中,本发明特征在于用于治疗Rac-GTP酶介导的病症的方法。 所述方法包括向有需要的受试者施用有效量的本文描述的一种或多种化合物。
[0029] Rac-GTP酶介导的病症实例包括心血管疾病、免疫缺陷疾病、炎性疾病和癌症。Rac 的实例包括Racl、Rac2和Rac3。Rac-GTP酶的实例包括Racl-GTP酶、Ra C2-GTP酶和Ra C3-GTP 酶。
[0030] 术语"治疗(treating) "或"治疗(treatment) "是指向患有可用这样的化合物治 疗的病症或这样的病症的症状或向这样的病症发展的趋势的受试者施用本文描述的一种 或多种化合物,以赋予治疗效果,例如治愈、缓解、改变、影响、改善或预防上文所述的病症、 它的症状或向其发展的趋势。
[0031] 本文所描述的化合物包括化合物自身,以及它们的盐、前药和溶剂化物,如果适 用。前药的实例包括酯类和其他药学上可接受的衍生物,其在施用于受试者时能够提供活 性化合物。溶剂化物是指活性化合物和药学上可接受的溶剂之间形成的复合物。药学上可 接受的溶剂包括水、乙醇、异丙醇、醋酸乙酯、醋酸和乙醇胺。
[0032] 用于治疗上文描述的病症的含有本文描述的一种或多种化合物的组合物以及这 样的组合物在制备用于所提及的治疗的药物中的用途也在本发明范围内。
[0033] 一个或多个实施方案的细节阐述于下文说明书中。其他特征、目标和优点将因描 述、附图和权利要求而明显。
【附图说明】
[0034] 图1描述了 Rac和它各自的GEF,Tiam,之间生物模拟(in silico)对接相互作用。
[0035] 图2显示了来自于初始虚拟生物模拟筛选的五个先导Rac抑制剂的生物模拟 对接模型。化合物1、2、3、4和5分别是指化合物ALB-H05505197、47184181、T6590019、 PB295833004 和 0SSK_373747。
[0036] 图3是证明来自于初始虚拟生物模拟筛选的10个先导化合物在RHl细胞中对增 殖的剂量依赖性抑制的图示,通过MTS测定测量。所述五个先导化合物用红色标出。
[0037] 图4显示来自所述虚拟生物模拟筛选的11个化合物的下拉测定的结果。测定表 明Rac-GEF相互作用的干扰。同样显示了化合物NSC 23766的结果。整体Racl显示为上 样对照。所述5个先导化合物用红色标出。
[0038] 图5是说明先导化合物中的4个,即化合物2、3、4和5在SEM细胞中对增殖的剂 量依赖性抑制的图示,如MTS测定所测量的。显示了 5μ Μ、1〇μ Μ、20μ Μ、40μ Μ、80μ M 和160 μ M化合物浓度的结果。同样显示了化合物NSC 23766的抑制活性。
[0039] 图6是说明先导化合物中的4个,即化合物2、3、4和5在MV411细胞中对增殖的剂 量依赖性抑制的图示,如MTS测定所测量的。显示了每个化合物在5 μ Μ、1〇 μ Μ、20 μ Μ、 40 μ M、80 μ M和160 μ M浓度时的增殖抑制效力。
[0040] 图 7 是示出七个细胞系即 REH、SEM、MV411、RS411、Jurkat、Raji、Nom〇-l、Nalm6 和 ML2对20 μ M的五个先导化合物的敏感性的表格。
[0041] 图8是显示将正常小鼠骨髓暴露于独自为20或80 μ M的所述先导五个化合物之 后0.75x IO5个细胞的平均克隆数目的图示。DMSO和"无处理"被用作负对照。同样显示 了暴露于化合物NSC23766后的数据。
[0042] 图9总体显示化合物5,即化合物0SSK_373747对细胞凋亡、细胞死亡和GTP-Rac 相互作用的影响。图9a是显示暴露于化合物0SSK_373747后凋亡和死亡SEM细胞的百分比 的图示。图9b展示暴露于0SSK_373747五分钟和60分钟的细胞中RAC-GTP的下拉测定。 同样显示了化合物NSC 23766的下拉分析。
[0043] 图10显示化合物OSSK_373747的体内药物动力学和代谢稳定性。
[0044] 图11说明化合物5即OSSK_373747的可能的水解产物,产物#1和产物#2。
[0045] 图12列出通过祀点扩张 (hit expansion)药物筛选所鉴定的另外的可能先导化 合物,即化合物6、7、8、9、10和11。它们每一个都是从所述初始筛选鉴定的所述先导化合物 即化合物2-5的类似物。
[0046] 图13展示靶点扩张药物筛选的化合物6-11在20和80 μ M的浓度对SEM细胞的 增殖的抑制。
[0047] 图14展示化合物3、4、5、6、8、10和11在20和8(^河的浓度对驟411细胞的增 殖的抑制。
[0048] 图15总体显示化合物6-11的效力。图15a是展示七种细胞系REH、SEM、MV411、 Jurjkat、Raji、Nomo-I和Nalm6对新的类似物化合物6-11的敏感性的表格。图15b显示 将化合物暴露于细胞5和60分钟之后两个类似物化合物6和7的下拉测定。同样显示了 化合物NSC 23766的结果。整体Rac蛋白显示为上样对照。
[0049] 图16是描述第二靶点扩张筛选获得的19个化合物对SEM细胞增殖的百分比抑制 的图示。同样显示化合物NSC 23766的结果。六个所选的先导化合物,化合物6-11,被红色 标出。
[0050] 图17是说明类似物化合物中一种,化合物7即T5602471,在Raji细胞中对增殖的 剂量依赖性抑制的图示,如MTS测定所测量的。显示了 250ηΜ、500ηΜ、1 μ Μ、5 μ Μ、20 μ M 和80 μ M浓度的化合物的结果。同样显示了化合物NSC 23766的抑制活性。
[0051] 图18显示经由两种施用途径的化合物7的体内药物动力学。
[0052] 图19总体展示化合物7,即Τ5602471,的体内耐受性。图19a是50mg/kg、100mg/ kg、250mg/kg和500mg/kg给药之后小鼠中作为血浆浓度测量值的体内耐受性的表格。图 1%是展示5〇11^/1^、10〇11^/1^、25〇11^/1^和50〇11^/1^给药之后小鼠中作为体重测量值的化 合物7的体内耐受性的图示。
[0053] 图20总体说明单次或两次化合物给药之后化合物7即T75602471的IC5tl。图20a 是展示如MTS测定所测量的化合物7对MV411细胞增殖的剂量依赖性抑制。显示了单次或 两次化合物给药之后250nM、500nM、1 μ M、5 μ M、10 μ M、20 μ M和80 μ M的化合物浓度 的结果。同样显示了化合物NSC 23766的抑制活性。图20b是将单次或两次化合物给药之 后六个白血病细胞系即SEM、Nomo、RS411、MV411、Jurkat和REH中化合物7的IC5tl标出的 表格
【具体实施方式】
[0054] 本公开涉及基于Rho家族成员Rac与其特异性激活剂GEF、Tiam之间的相互作用 使用定量的高通量测定鉴定具有抗癌活性的某些化合物,和所述化合物单独对Rac2晶体 结构的生物模拟。化合物出乎意料地表现出对白血病细胞体外增殖的抑制,以及在某些化 合物的情况下,对正常骨髓细胞的最小毒性。
[0055] 本文描述的所有化合物可以通过本领域熟知的方法制备和/或从商业来源获得。 例如,这些化合物可以是从Evotec AG的EVOsource数据库鉴定的并且可以是从商业来源 例如Sigma-Aldrich (St. Louis, MI)购买的。合成化合物可以通过适当的方法例如柱层析、 高压液相色谱或重结晶纯化。
[0056] 本文描述的化合物可能包含非芳香族双键以及一个或多个不对称中心。因此,它 们可以作为外消旋物和外消旋的混合物、单一对映体、单个非对映异构体、非对映异构体混 合物和顺式-或反式-同分异构形式。所有这些同分异构体形式均被预期。
[0057] 化合物可以通过筛选法,例如鉴定抑制癌细胞增殖的化合物的测定鉴定。可替换 地或另外,化合物可以使用鉴定抑制靶蛋白(例如Rac GTP酶)活性的化合物的测定,和/ 或通过对靶蛋白结构上的化合物对接的生物模拟分析来鉴定。
[0058] 例如,筛选方法可以包括将白血病细胞系,例如REM、SEM、MV411、RS411、Jurkat、 Raji、N〇m〇-l、Maim6和/或ML2暴露于不同剂量的化合物不同时间段。抑制细胞生存的候 选化合物可以基于化合物存在的情况下细胞增殖的能力来鉴定。这样的筛选方法可以是在 包括从来自特定细胞系的细胞、液体培养基和候选化合物的容器中进行。容器可以是,例如 培养皿、组织培养瓶、24孔板、48孔板、96孔板、384孔板、1536孔板、3456孔板或任何其它 适合的容器。在高通量筛选方法中,容器的每个孔可以含有不同的候选化合物。如本领域 中应理解的,筛选方法可以自动化以获得高通量。例如,MTS测定可以在标准的微量滴定板 中于液体培养基中进行。此外,由于板的手工筛选可能缓慢、劳动密集型并且主观,自动化 的染色方法可以用于高通量筛选的方法中来区分活细胞和死细胞。
[0059] 本说明书还提供了包括式(I)-(VI)描述的至少一个(例如至少2、3、4或至少6 个)化合物(例如化合物1-12)或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的载体的药物组 合物。
[0060] 本文所述化合物能诱导细胞增殖的抑制。对细胞增殖的抑制作用的诱导可能意味 着在细胞中诱导或增强对增殖信号的抑制。例如,对增
殖抑制的诱导可能意味着在细胞中 诱导或增强的细胞死亡。作为另一个实例,对增殖抑制的诱导可能意味着在细胞中诱导或 增强细胞凋亡。作为另一个实例,对增殖抑制的诱导可能意味着在细胞中诱导或诱导静止 期状态。作为还有另一个实例,对增殖抑制的诱导可能意味着诱导或增强自噬作用。因此, 本文所描述的化合物可以用于诱导在细胞中抑制增殖的方法,包括将细胞与有效量的本文 描述的化合物、盐或组合物接触,以诱导细胞中的增殖抑制。接触可以体外或体内完成。
[0061] 在一些实施方案中,本公开特征在于一种治疗Rac-GTP酶介导的病症的方法。所 述方法包括向有需要的受试者(例如患者)施用有效量的含有本文描述的一种或多种化合 物的药物组合物。Rac-GTP酶介导的病症的实例包括心脑血管疾病、免疫缺陷疾病、炎性疾 病和癌症。
[0062] 术语"患者"在整个说明书用于描述根据本发明提供的方法治疗的动物,人类或非 人类。兽医应用明确是本发明所考虑的。所述术语包括但不限于鸟类、爬行动物、两栖动物 和哺乳动物,例如人类、其他的灵长类、猪、啮齿类例如小鼠和大鼠、兔、豚鼠、仓鼠、牛、马、 猫、狗、羊和山羊。优选的受试者是人、农场动物和家养宠物例如猫和狗。
[0063] 细胞增殖和/或分化病症的实例包括癌症,例如癌、肉瘤、转移性病症和造血肿瘤 性病症例如白血病。
[0064] 转移性肿瘤可源于多种原发肿瘤类型,包括但不限于前列腺、乳腺、结肠、肺、骨和 肝起源的那些。例如当肿瘤细胞从附着于血管内皮细胞的原发肿瘤脱落,侵入周围组织并 在与原发肿瘤不同的部位生长形成独立的肿瘤时,转移发展。
[0065] 术语"癌症"是指具有自主生长能力的细胞。这样的细胞的实例包括具有由快速 增殖细胞生长为表征的异常状态或病况的细胞。所述术语意指包括癌症的生长,例如肿瘤 (例如实体瘤);致癌过程,转移组织和恶性转化的细胞、组织或器官,不论侵袭的病理类型 或阶段。还包括不同器官系统的恶性肿瘤,例如呼吸、心血管、肾脏、生殖、神经、血液、肝脏、 胃肠道和内分泌系统;以及包括恶性肿瘤例如结肠癌、肾细胞癌、前列腺癌和/或睾丸肿 瘤、非小细胞肺癌、小肠癌和食道癌的腺癌。"自然发生"的癌包括不是通过将癌细胞放入受 试者而实验诱导的任何癌症,并且包括例如自发发生的癌症、患者暴露于致癌物引起的癌 症、插入转基因的癌基因或敲除肿瘤抑制基因导致的癌症,以及感染例如病毒感染引起的 癌症。术语"癌"是本领域认可的并且是指上皮或内分泌组织的恶性肿瘤。该术语也包括 癌性肉瘤,其包括癌瘤性和肉瘤性组织组成的恶性肿瘤。"腺癌"是指来源于腺体组织或其 中肿瘤细胞形成可识别的腺体结构的癌。
[0066] 术语"肉瘤"是本领域认可的并且是指间质细胞来源的恶性肿瘤。术语"再生性造 血障碍"包括涉及造血来源的增生细胞/瘤形成细胞的疾病。再生性造血障碍可起源于骨 髓、淋巴或红细胞系统,或者其前体细胞。
[0067] 可使用本发明的方法和组合物治疗的癌症包括例如,除了其他的之外,胃癌、结肠 癌、直肠癌、口腔/咽癌、食道癌、喉癌、肝癌、胰腺癌、肺癌、乳腺癌、宫颈癌、子宫癌、卵巢 癌、前列腺癌、睾丸癌、膀胱癌、皮肤癌、骨癌、肾癌、脑癌/中枢神经系统癌、头癌、颈癌和咽 喉癌;霍奇金病、非霍奇金白血病、肉瘤、绒毛膜癌和淋巴癌等等。
[0068] 认为处于患癌症风险的个体可特别受益于本发明,这主要是因为预防性治疗可以 在有任何病症证据之前开始。"处于风险"的个体包括,例如,暴露于(例如通过食入、例如 通过吸入和/或摄取)统计学上显示可促进敏感个体内癌症的水平的致癌物的个体。也包 括由于暴露于紫外线或他们所处的环境、职业和/或遗传等因素而处于风险的个体,以及 表现出前癌病况诸如息肉的那些。相似地,处于癌症或转移发展的非常早期的个体(例如, 仅一个或几个异常细胞存在于个体体内或个体组织内特定部位)可能会受益于这样的预 防性治疗。
[0069] 可以用本文所描述的化合物治疗的细胞增殖和/或分化病症的其他实例包括炎 性疾病和骨吸收障碍。炎性疾病的实例包括神经退行性疾病、多发性硬化、系统性红斑狼 疮、类风湿性关节炎、动脉粥样硬化、脑炎、脑膜炎、肝炎、肾炎、脓毒症、结节病、银肩病、湿 瘆、荨麻瘆、I型糖尿病、哮喘、结膜炎、中耳炎、过敏性鼻炎、慢性阻塞性肺疾病、鼻窦炎、皮 炎、炎性肠病、溃疡性结肠炎、克罗恩病、白塞氏综合症、痛风、病毒感染、细菌感染、器官移 植病况、皮肤移植病况、移植排斥反应(包括同种异体排斥反应和移植物抗宿主病)、脊柱 关节病、硬皮病、血管炎和银肩病(包括T细胞介导的银肩病)。其他炎性疾病中已经在例 如美国申请公开第20020155166号中描述,其内容全部通过引用并入本文。
[0070] 在一些实施方案中,本公开特征在于治疗患者中不需要的血管生成的方法。所述 方法包括向诊断为患有不需要的血管生成或处于不需要的血管生成风险的患者施用有效 量的含有本文描述的一种或多种化合物的药物组合物。所述方法可以任选包括鉴定(例如 诊断)患者为患有不需要的血管生成或处于不需要的血管生成风险的步骤。
[0071] 在一些实施方案中,本公开特征在于治疗与不需要的血管生成相关的病况的方 法。所述方法包括向诊断为患有与不需要的血管生成相关的病况或处于与不需要的血管生 成相关的病况风险的患者施用有效量的含有本文描述的一种或多种化合物的药物组合物, 其中与不需要的血管生成相关的病况不是癌症。所述方法可以任选包括鉴定(例如诊断) 患者为患有与不需要的血管生成相关的病况或处于与不需要的血管生成相关的病况风险 的步骤。在实施方案中,病况是类风湿性关节炎、狼疮、银肩病、糖尿病视网膜病变、早产儿 视网膜病变、黄斑变性、角膜移植排斥反应、新生血管性青光眼、晶状体后纤维增生、发红、 柳条韦伯综合症、心肌血管新生、斑块内新生血管、毛细血管扩张或鼻咽血管纤维瘤或其任 何组合。 治疗方法
[0072] 熟练的本领域人员将理解的是,患者可以被医师(或兽医师,作为对被诊断的患 者来说适合的)通过本领域已知的任何方法例如通过评价患者病史,进行诊断性测试和/ 或采用成像技术,诊断为患有本文描述的病况,例如癌症或者处于本文描述的病况例如癌 症的风险。
[0073] 熟练的本领域人员还将理解的是本文描述的组合物并不需要由诊断患者患病 (或给患者开具组合物处方)的相同个体施用于患者。可以由例如诊断和/或开具处方的 个体和/或其他任何个体,甚至包括患者她/他自己(例如当患者能自行施用时)施用组 合物(和/或监督施用)。
[0074] 对治疗本文描述的病症例如癌症有效的组合物的量可以由医师或兽医师施用于 (或开具处方给)患者,在患者被诊断为患有这些病症或病况中的任一种或具有与患者将 发展这样的病症或病况的可能性增加相关的任何危险因素(例如患者最近曾经或正在暴 露于致癌物)的当天。组合物可以间歇或持续施用于患者。组合物可以施用于患者达1、2、 4、6、8、10、12、14、18或20天,或长于20天例如1、2、3、5或6个月,或直到患者不再出现病 况或病症的症状,或直到患者被诊断不再处于病况或病症风险。在给定日期内,组合物可以 持续施用整天或间歇施用多达23小时每天,例如多达20、15、12、10、6、3或2小时每天,或 多达1小时每天。
[0075] 如果患者需要化学治疗、放射治疗、免疫治疗、基因治疗和/或外科治疗(例如因 为医师或兽医师开具处方),患者可以在施用化学治疗、放射治疗、免疫治疗、基因治疗和/ 或外科治疗之前、过程中或之后用本文描述的组合物治疗。例如,对于化学治疗、免疫治疗、 基因治疗和放射治疗,组合物可以间歇或连续地施用于患者,在施用化学治疗、免疫治疗、 基因治疗或射线治疗之前(并且在给予多个剂量时,在每个单个剂量之前)〇到20天开始, 例如在所述施用之前至少约30分钟开始,例如约1、2、3、5、7或10个小时,或约1、2、4、6、 8、10、12、14、18或20天,或超过20天。可替换地或另外,组合物可以与化学治疗、免疫治 疗、基因治疗或放射治疗的施用同时施用。可替换地或另外,组合物可以在化学治疗、免疫 治疗、基因治疗或放射治疗之后施用于患者,例如在施用后立即开始并持续或间歇地继续 约1、2、3、5、7或10小时,或约1、2、5、8、10、20、30、50或60天,一年,无限制或直到医师确 定不再需要施用所述组合物。对于外科手术,组合物可以在外科手术施行之前、过程中和/ 或之后系统或局部施用于患者。组合物可以在手术之前间歇或持续施用于患者1小时、2小 时、3小时、4小时、6小时、12小时或约1、2、4、6、8、10、12、14、18或20天或超过20天。它 可以在外科治疗之前立即施用一段时间并且任选地继续整个手术或者施用可以在外科治 疗开始至少15分钟之前停止(例如在外科治疗开始至少30分钟、1小时、2小时、3小时、6 小时或24小时之前)。可替换地或另外,组合物可以在手术过程中施用于患者,例如通过表 面施用。可替换地或另外,组合物可以在手术之后施用于患者,例如手术完成之后立即开始 并继续约1、2、3、5、7或10小时或约1、2、5、8、10、20、30、50或60天,1年,无限制或直到患 者在手术完成之后不再患有癌症或处于癌症风险。
[0076] 对B细胞慢性淋巴细胞白血病的治疗可包括组合化疗方案的施用。在许多情况 下,氟达拉滨与烷基化试剂或单克隆抗体的组合可以用于B-CLL的治疗。例如,氟达拉滨可 以在具有烷基化诸如环磷酰胺或苯达莫司汀的组合治疗中施用。氟达拉滨也可以与单克隆 抗体诸如阿仑单抗、利妥昔单抗或奥法木单抗组合施用。氟达拉滨还可施用用于与所有下 列物质组合在一起治疗B-CLL :烷基化试剂、蒽环类抗生素、长春花生物碱和皮质类固醇。 例如,氟达拉滨可以与环磷酰胺、阿霉素、长春新碱和泼尼松龙一起施用。
[0077] 治疗急性淋巴细胞白血病(ALL)可以包括下列物质的施用:强的松、长春新碱、蒽 环类药物、L-门冬酰胺酶、环磷酰胺。
[0078] 治疗慢性粒细胞白血病(CML)可以包括伊马替尼的施用。幼淋巴细胞性白血病的 治疗可以包括嘌呤类似物、苯丁酸氮芥和各种化疗包括:环磷酰胺、阿霉素、长春新碱、强的 松环磷酰胺、阿霉素、长春新碱和泼尼松龙、依托泊苷、博莱霉素 VAPEC-B和阿仑单抗。
[0079] 涵盖白血病的疾病的治疗可包括下列治疗试剂和这些治疗方案的组合:在许多情 况下,氟达拉滨,烷基化试剂诸如环磷酰胺或苯达莫司汀,单克隆抗体诸如阿仑单抗、利妥 昔单抗或奥法木单抗,蒽环类抗生素诸如阿霉素,长春花生物碱,蒽环类,L-门冬酰胺酶,环 磷酰胺,伊马替尼,嘌呤类似物,苯丁酸氮芥,环磷酰胺,阿霉素,长春新碱,强的松,环磷酰 胺,阿霉素,长春新碱和泼尼松龙,依托泊苷,博莱霉素 VAPEC-B和阿仑单抗和/或皮质类固 醇。 组合治疗
[0080] 在一些实施方案中,本申请的化合物或其药学上可接受的盐可与另一种治疗试剂 组合使用以治疗疾病诸如癌症。例如,另外的试剂可以是本领域认可对治疗如本文描述的 由本申请的化合物治疗的疾病或病况有用的治疗试剂。另外的试剂还可以是为治疗组合物 提供有益贡献的试剂(例如影响所述组合物粘性的试剂)。
[0081] 本发明考虑的组合治疗包括,例如以单一药物制剂的形式施用本申请的一种或多 种化合物或其药学上可接受盐以及另外的试剂,以及以分别的药物制剂的形式施用本申请 的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐以及另外的试剂。可替换地或另外,组合治疗 可包括以单一或分别的药物制剂施用本文描述的至少两种化合物或其药学上可接受的盐。 换言之,共施用应意味着向受试者施用至少两种试剂,以提供两种试剂组合的有益效果。例 如,可以同时或依序施用所述试剂一段时间。
[0082] 本文阐述的试剂是为了说明目的而非意在限定。作为本发明一部分的所述组合可 以是本申请的化合物和选自本申请概述中讨论的化合物的至少一种另外的试剂。所述组合 还可以包括多于一种另外的试剂,例如,两种或三种另外的试剂,条件是所述组合使所形成 的组合物能够行使其预期功能。
[0083] 例如,本文所述的方法可以与上文引述的治疗和组合治疗组合使用。 药物制剂和剂型
[0084] 当作为药物使用时,本申请的化合物可以以药物组合物的形式施用。这些组合物 可以以制药领域熟知的方式来制备,并且可以通过多种途径施用,取决于期望的是局部治 疗还是系统治疗以及有待治疗的区域。施用可以是表面的(包括透皮、表皮、眼部以及对 黏膜,包括鼻内、阴道和直肠递送),经肺的(例如通过粉末或气雾剂的吸入或吹入,包括通 过喷雾器;气管内或鼻内),口服或胃肠外的。胃肠外施用包括静脉内、动脉内、皮下、腹膜 内、肌内或者注射或输注;或者颅内的例如鞘内或心室内施用。胃肠外施用可以是单次弹丸 (bolus)剂量的形式,或者可以是例如通过持续的灌注泵。
[0085] 用于表面施用的药物组合物和制剂可以包括透皮药贴、药膏、乳剂、霜剂、凝胶、滴 剂、栓剂、喷雾、液体和粉末。常规的药物载体,含水的、粉末或油状基础剂、增稠剂,以及类 似物可能是必需或期望的。
[0086] 在本公开范围内的还有包含本文描述的至少一种化合物和药学上可接受的载体 的药物组合物。此外,本公开涵盖向患有癌症的患者施用有效量的本文描述的化合物的方 法,例如在药物
组合物中,例如如本文所述的。"有效量"或"有效的量"是赋予所治疗的患 者治疗效果所需要的活性化合物的量。有效剂量会变化,如本领域技术人员所认可的,取决 于所治疗的疾病的种类,施用途径,辅料使用以及与其他治疗处理共同使用的可能性。
[0087] 治疗化合物的剂量、毒性和治疗效力可以由在细胞培养或实验动物中的标准药学 程序确定,例如用于确定LD50 (对于50%的群体致命的剂量)和ED50 (在50%的群体中治 疗有效的剂量)。毒性和治疗性效果之间的剂量比为治疗指数,它可以表示为比率LD50/ ED50。显示出高治疗指数的化合物是优选的。而可使用显示毒副作用的化合物时,应当注 意设计将这样的化合物靶向受影响组织的位点的递送系统,以便将对未感染细胞的损害最 小化,从而降低副作用。
[0088] 从细胞培养测定和动物研宄中获得的数据可被用于制定用于人类的剂量范围。这 些化合物的剂量优选地落在包括ED50而几乎没有或没有毒性的循环浓度范围中。剂量可 根据采用的剂型和使用的施用途径在此范围中变化。对于本发明的方法中所使用的任何化 合物,治疗上有效的剂量可以从细胞培养测定进行最初估计。可在动物模型中制定剂量以 达到细胞培养中测定的包括IC50 (即达到对症状最大抑制作用的一半的试验化合物浓度) 的循环血浆浓度范围。这些信息可以用于更精确地确定人类中的使用剂量。血浆中的水平 可通过例如高效液相色谱来测量。
[0089] 通常的剂量可在约0· 01 μ g/kg至约50mg/kg (例如从约0· 1 μ g/kg至约25mg/kg、 从约1 μ g/kg至约10mg/kg、从约10 μ g/kg至约5mg/kg或从约0· lmg/kg至约lmg/kg)体 重每天的范围内。在一些实施方案中,适合的每日剂量可在约10 μ g/kg至约100 μ g/kg体 重的范围内。
[0090] 为了实行本公开中描述的方法,具有本文描述的一种或多种化合物的组合物可以 胃肠外、口服、经鼻、直肠、局部和/或向颊施用。术语"胃肠外"如本文所用的是指皮下、皮 内、静脉内、肌内、关节内、动脉内、滑膜内、胸骨内、鞘内、病损内和颅内注射或,以及任何适 合的输注技术。
[0091] 无菌可注射组合物可以是无毒的胃肠外可接受稀释剂或溶剂诸如1,3-丁烷二醇 中的溶液或悬浮液。可以采用的可接受的介质和溶剂可以是甘露醇、水、林格氏溶液和等 渗氯化钠溶液。另外,固定的油常规用作溶剂或悬浮介质(例如合成的甘油单酯或甘油二 酯)。脂肪酸诸如油酸或其甘油酯衍生物在可注射制剂的制备中有用,和天然的药学上可接 受的油诸如橄榄油或蓖麻油特别是它们的聚乙氧基化的形式一样。这些油溶液或悬浮液还 可含有长链醇稀释剂或分散剂、羧甲基纤维素或类似分散剂。用常用于制造药学上可接受 的固体、液体或其它剂型的其他通常使用的表面活性剂,诸如吐温或司盘或其它相似的乳 化剂或生物利用度增强剂,也可用于配制的目的。
[0092] 口服施用的组合物可为任何口服可接收的剂型,包括胶囊、片剂、乳液以及含水悬 液、分散物和溶液。在片剂的情况下,常用的载体包括乳糖和玉米淀粉。通常还添加润滑剂, 诸如硬脂酸镁。对于胶囊形式的口服施用而言,有用的稀释剂包括乳糖和干玉米淀粉。当口 服施用含水混悬液或乳液时,活性成分可与乳化剂或悬浮剂一起混悬或溶解在油相中。如 需要,可加入某些甜味剂、调味剂或着色剂。
[0093] 鼻喷雾或吸入组合物可根据药物制剂领域熟知的技术来制备。例如,这样的组合 物可使用苄醇或其他合适的防腐剂、增强生物利用度的吸收促进剂、氟碳化合物和/或本 领域已知的其他增溶剂或分散剂制备为盐水溶液。
[0094] 具有本文描述的一种或多种活性化合物的组合物也可以用于直肠施用的栓剂形 式施用。
[0095] 药物组合物中的载体必须为"可接受的",其含义为其与组合物的活性成分相容 (以及优选地能够稳定活性成分)并对所治疗的受试者无害。可使用一种或多种溶解剂作 为用于递送本文描述的活性化合物的药物赋形剂。其它载体的实例包括胶体二氧化硅、硬 脂酸镁、纤维素、十二烷基硫酸钠和D&CYellow#10。
[0096] 治疗性化合物也可以与保护治疗性化合物以免从体内快速消除的载体诸如控释 制剂包括植入物和微囊输送系统一起制备。可以使用可生物降解、生物相容的聚合物,例如 乙烯醋酸乙烯酯,聚酸酐,聚乙醇酸,胶原蛋白,多正酯类和聚乳酸。这样的配方可以是使用 标准技术制备或商业获得,例如从Alza Corporation和Nova Pharmaceuticals, Inc。脂质 体悬浮液(包括具有对细胞抗原的单克隆抗体的靶向所选择的细胞的脂质体)也可用作医 药上可接受的载剂。这些可以根据本领域技术人员已知的方法来制备,例如如美国专利第 4, 522, 811号中所述。
[0097] 药物组合物可以与施用说明书一起包括在容器、包装或分配器中。
[0098] 配制合适的药物组合物的方法是本领域中已知的,参见例如系列书籍Drugs and the Pharmaceutical Sciences :a Series of Textbooks and Monographs(Dekker,NY)〇
[0099] 上文描述的化合物可以通过本文描述的全有机体筛选方法对其治疗上述疾病的 效力进行初步筛选并且之后通过另外的动物实验和临床试验证实。其它的筛选方法也将是 对本领域一般技术人员来说明显的。 合成
[0100] 本申请的化合物,包括其盐,可以使用已知的有机合成技术制备并且可以根据各 种可能的合成路线中的任一种例如通过类似于Gerard等人.ACS Comb. Set 2011,13, 365 以及实施例部分进一步描述的方法来合成。
[0101] 用于制备本申请的化合物的反应可在有机合成领域的技术人员可容易地选择的 合适的溶剂中进行。适宜的溶剂可以在反应进行的温度例如在溶剂的凝固温度至溶剂的沸 点温度范围内的温度基本上与起始原料(反应物)、中间体或产物不反应。特定的反应可在 一种溶剂或一种以上溶剂的混合物中进行。根据具体的反应步骤,用于具体反应步骤的合 适的溶剂可由本领域技术人员选择。
[0102] 制备本申请的化合物的方法可涉及将各种化学基团的保护和脱保护。保护和脱 保护的需要以及选择适宜的保护基团可由本领域技术人员容易地确定。保护基团化学 可在例如 T.W. Greene 和 P.G.M. Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis,第 3 版,Wiley&Sons, Inc. ,New York(1999)中找到,其通过引用全文并入本文。
[0103] 反应可以根据本领域中已知的任何合适的方法进行监测。例如,产物的形成可以 通过光谱手段诸如核磁共振光谱法(例如1H或13C),红外光谱法,分光光度法(例如UV-可 见光的)、质谱法或者通过色谱法诸如高效液相色谱法(HPLC)、液相色谱-质谱(LCMS)或 薄层色谱(TLC)监测。如何由非光学活性起始原料制备光学活性形式的方法是本领域中已 知的,例如通过外消旋混合物的拆分或通过立体选择性合成。在本文所述的化合物中也可 以存在烯烃、C = N双键以及类似物的多种几何异构体,并且所有这些稳定的异构体都包括 在本发明中。描述了本申请的化合物的顺式和反式几何异构体,并且其可被分离为异构体 的混合物或分离的异构体形式。
[0104] 化合物的外消旋混合物的拆分可通过本领域已知的多种方法中的任何一种进行。 方法的实例包括使用为旋光活性的成盐有机酸的手性拆分酸的分级结晶。用于分级结晶方 法的合适的拆分剂为例如,旋光活性酸诸如酒石酸的D和L形式、二乙酰基酒石酸、二苯甲 酰基酒石酸、扁桃酸、苹果酸、乳酸或者各种旋光活性樟脑磺酸诸如β-樟脑磺酸。适用于 分级结晶方法的其它的拆分剂包括立体异构体纯形式的α-甲基苄基胺(例如S和R形式 或立体异构体纯形式)、2_苯基甘氨醇(2-phenylglycinol)、降麻黄碱、麻黄碱、N-甲基麻 黄碱、环己基乙基胺、1,2-二氨基环己烷以及类似物。
[0105] 外消旋混合物的拆分也可通过在用旋光活性拆分剂(例如二硝基苯甲酰基苯基 甘氨酸)填充的柱上洗脱来进行。合适的洗脱溶剂组分可由本领域技术人员确定。
[0106] 本申请的化合物还包括互变异构形式。互变异构形式是由于单键与相邻的双键 的转换以及伴随的质子迀移形成的。互变异构形式包括质子转移的互变异构体,其是具 有相同的经验式和总电荷的异构质子化态。质子转移的互变异构体的实例包括酮-烯醇 对、酰胺-亚胺酸对、内酰胺-内酰亚胺对、酰胺-亚胺酸对、烯胺-亚胺对以及其中质子 可以占据杂环体系的两个或更多个位置的环状形式,例如IH-咪唑和3H-咪唑,1H-、2H-和 4H-1,2, 4-三唑,IH-和2H-异吲哚和IH-和2H-吡唑。互变异构形式可以处于平衡态或通 过适当的取代在空间上锁定成一种形式。
[0107] 本申请的化合物也包括在中间体或最终化合物中出现的原子的所有同位素。"同 位素"包括具有相同原子序数但不同中子数的那些原子。例如,氢的同位素包括氚和氘。
[0108] 所有的化合物和其药学上可接受的盐可以与其他物质例如水和溶剂(例如水合 物和溶剂化物)一起存在,或可以是分离的。
[0109] 在一些实施方案中,本申请的化合物或其盐是基本上分离的。"基本上分离的"意 指化合物至少部分或基本上从其形成或被检测到的环境分离。部分分离可以包括,例如, 富含本申请的化合物的组合物。基本上分离可以包括含有按重量计至少约50%、至少约 60 %、至少约70 %、至少约80 %、至少约90 %、至少约95 %、至少约97 %或至少约99 %的本 申请的化合物或其盐的组合物。用于分离化合物和其盐的方法是本领域中常规的。
[0110] 本文中使用短语"药学上可接受的"是指在合理的医学判断范围内,适用于与人 和动物组织接触而无过度毒性、刺激、过敏反应或其它问题或并发症,与合理的利益/风 险比相称的那些化合物、物质、组合物和/或剂型。本发明还包括本文所描述的化合物的 药学上可接受的盐。如本文中所用的,"药学上可接受的盐"是指所公开的化合物的衍生 物,其中母本化合物通过将存在的酸或碱部分转化为其盐形式来修饰。药学上可接受的 盐的实例包括但不限于碱性残基例如胺的矿物或有机酸盐;酸性残基例如羧酸的碱或有 机盐;以及类似物。本申请的药学上可接受的盐包括,例如从无毒的无机或有机酸形成 的母本化合物的常规无毒盐。本申请的药学上可接受的盐可通过常规化学方法从含碱性 或酸性部分的母本化合物合成。通常,这样的盐可通过在水或在有机溶剂或在两种溶剂 的混合物中使这些化合物的游离酸或碱形式与化学计量量的适当的碱或酸反应来制备; 通常非水溶媒像是乙醚、乙酸乙酯、醇类(例如甲醇、乙醇、异丙醇或丁醇)或乙腈(ACN) 是优选的。适宜的盐的目录可在Remington's Pharmaceutical Sciences,第17版, Mack Publishing Company, Easton, Pa.,1985,第 1418 页和 Journal of Pharmaceutical Science, 66, 2 (1977)中找到,其每一个通过引用全文并入本文。 试剂盒
[0111] 本发明还包括用于例如治疗或预防Rac-GTP酶介导的病症(例如癌症)的试剂 盒,其包括一个或多个含有药物组合物的容器,所述药物组合物含有治疗有效量的本申请 的化合物。这样的试剂盒可还包括,如果需要,一个或多个各种常规试剂盒组件,诸如例如, 具有一种或多种药学上可接受的载体的容器、另外的容器等,对本领域技术人员来说是明 显的。也可将表明有待施用的组分的量、施用指南和/或混合组分指南的说明书,作为插页 或标签,包括在试剂盒中。
[0112] 本文引用的所有出版物(例如专利、专利申请、出版物和文章)的内同均通过应用 全文并入本文。 实施例
[0113] 下文具体实施例将被解释为仅仅是说明性的而不以任何方式限制本公开的其余 部分。没有进一步的阐述,据信本领域技术人员将能够根据本文的描述最大限度利用本发 明。 实施例1 :Rac抑制剂的牛物樽拟筛诜 方法
[0114] Rac-GEF相互作用为了进行对Rac抑制剂的虚拟筛选,需要Rac2晶体结构上的 生物模拟对接。进行了 Rac-GEF相互作用的生物模拟对接以辨认Rac蛋白上的潜在靶位 点,在其上的小分子结合将导致GEF与蛋白的相互作用中断。图1显示了 GEF TIAM以及 RAC(TIAM-Rac)的模型。Rac显示为灰色而TIAM描述为棒模型。Tiam的Trp56残基用蓝色 标出。描绘的是中断Rac-GEF相互作用的可能定位的"热点"。作描绘的"热点",定义Tiam 和Rac具有显著相互作用的靶定位,显示为黄色表面。GTP分子也存在。
[0115] 生物模拟筛选对来自Evotex AG库的一千四百万个化合物进行筛选。用于类药物 表征的特定过滤器产生了四百八十万个化合物。选择这些化合物进行对接。应用内部算法 以将所选择的化合物之间的化学多样性最大化。Rac2晶体结构上化合物的生物模拟对接 和前一百二十万个的化合物被选择用于进一步的评估。这表示选
择了所选择的化合物的前 30%。这些化合物分为两组分析。第一组的化合物通过在Racl结构上化合物的对接来分 析,并基于Rac-I和Rac-2两者中相似的结合模式,在Rac-I和Rac-2两者上的高对接得分 以及与对已知活性化合物的结合假设匹配的药效基团,来选择。第二组的分析涉及使用ASP 和Chemscore的评分功能来重新评分对接姿势,并选择对所有3个评分方法即Gold、ASP、 Chemsc均具有高得分的化合物。
[0116] 结果在选择不同集合时以及在肉眼检测之后,从第1组选出75种化合物。在选择 不同集合时以及在肉眼检测之后,从第2组选出77种化合物。这优先的152种化合物中, 从商业来源购买到100种便进一步筛选。 实施例2 :先导化合物的诜择 方法
[0117] 增殖的剂量依赖性抑制通过MTS ((3-(4, 5-二甲基噻唑-2-基)-5-(3-羧基甲 氧基苯基)-2-(4-磺基苯基)-2H-四唑))测定来测定从最初的生物模拟筛选选择的100 种化合物在两个白血病细胞系SEM和REH中的增殖抑制。将用于MTS测定的细胞旋降并 再悬浮。之后将细胞悬浮液分开并以所期望的浓度加入有待测试的化合物并且随后平 铺。孵育期后,加入MTS 试剂(Promega CellTiter 96? Aqueous Non-Radioactive Cell Proliferation Assay)并允许孵育。随后在490nm处使用平板读数器测量吸光度。
[0118] 分析每种化合物对细胞增殖的影响。这些化合物中的10种各自在5 μ Μ、1〇 μ M、 20 μ M、40 μ M和160 μ M在REH细胞中的剂量依赖性增殖抑制,如通过MTS测定所测量 的,显示在图3中。
[0119] 为了确定应该进一步研宄这些化合物中的哪一个,进行生化下拉测定以确认Rac 和GTP酶之间相互作用的中断所表现的对Rac活化的特异性抑制。所述测定最初要求处理 细胞,之后下拉并用蛋白质印迹分析。细胞首先在无血清培养基中饥饿2小时。之后将它们 重新悬浮在含有血清的培养基中和并以需要的浓度加入抑制剂。孵育期望的时间长度后, 将细胞成团并用镁裂解缓冲液(Millipore Mg2+裂解/清洗缓冲液)裂解。之后用Pak小 珠 (Millipore Rac/cdc42 Assay Reagent(PAK_lPBD,琼脂糖)收集 Rac 蛋白和任何结合的 蛋白。随后结合的蛋白用裂解缓冲液移出并经受蛋白质印迹分析。 结果
[0120] 从分析中鉴定出五个化合物(即化合物1-5)为先导化合物。这些化合物在图3 和4b中用红色标出。代表性的蛋白质印迹分析显示其中化合物的剂量依赖性的存在导致 Racl-GTP酶蛋白减少。也显示裂解物中Racl存在。也显示化合物NSC23776的下拉分析, 其为已知的Racl结合以及经由Rac-特异性RhoGEF的Rac活化的小抑制剂。 实施例3 :对先导化合物(即化合物1-5)在抑制白血病细朐系h的效力的分析方法
[0121] 进一步分析五种先导化合物即化合物1-5在不同剂量对不同白血病细胞的细胞 增殖影响。首先,五种化合物中的每一种以20 μ M的浓度在九种白血病细胞系中筛选: REH、SEM、MV411、RS411、Jurkat、Ra j i、Nomo-I、Naim6 和 ML2。SEM 和 MV411 细胞中进一步 测试先导化合物中的四种,化合物2、3、4和5,在一定浓度范围内的增殖抑制。为了定量细 胞增殖的百分比抑制,如上文实施例2中所描述的完成MTS分析。 结果:
[0122] 利用MTS测定定量细胞分别暴露于先导化合物中的四种时对细胞增殖的抑制。图 5显示了分别暴露于5 μ M、10 μ M、20 μ M、40 μ M、80 μ M和160 μ M的每种化合物,化合 物2、3、4和5,之后,SEM细胞增殖的百分比抑制。同样显示化合物NSC23776的结果用于比 较。
[0123] 同样进行MTS分析,以确定先导化合物中的四种对MV411细胞的剂量依赖性增殖 抑制。测试5 μ Μ、1〇 μ Μ、20 μ Μ、40 μ Μ、80 μ M和160 μ M的化合物2、3、4和5中每一 种对MV411细胞的影响。图6描述了化合物以不同浓度存在时MV411细胞上进行的测定的 结果。
[0124] 图7概述五种先导化合物,化合物1-5,在20 μ M的剂量对九种细胞系的增殖抑制 的影响。 实施例4 :对化合物2-5毒件的筛诜. 方法
[0125] 在正常骨髓造血祖细胞中筛选先导化合物中四种(化合物2、3、4和5)的毒 性。甲基纤维素中将正常BL-6小鼠骨髓形成的平均集落在分别暴露于5 μ Μ、20 μ M或 80 μ M浓度的四个先导化合物后计数。进行甲基纤维素中的集落测定以测试集落形成。将 MethoCult基质(StemCell Tech#03134)与下列剂混合:胎牛血清、牛血清白蛋白、IL-3、 mSCF、EP0、β -巯基乙醇、青霉素、链霉素、L-谷氨酰胺和MDM,并添加到正常骨髓细胞。悬 浮液中的细胞之后铺板并在7天后将获得的集落计数。 结果
[0126] 这些实验的结果图示于图8中。与其他化合物相比,0SSK_373747(即化合物5)显 示在20 μ M或80 μ M的浓度对正常细胞的最小毒性。 实施例5 =OSSK 373747对细朐凋亡和RAC-GTP相互作用的效果
[0127] 现有实验表明,化合物5,即0SSK_373747,与其他化合物相比具有强效力但毒性 低。对化合物5进行额外的分析来测试其对细胞凋亡、细胞死亡和Rac-GTP酶相互作用的 影响。图9A表明SEM细胞中0SSK_373747对细胞凋亡路径的影响。在将SEM细胞与20和 80 μ M的化合物5孵育后用Annexin V染色分析细胞凋亡的细胞和死细胞。图9b表明在 0SSK_373747存在时自暴露细胞5和60分钟之后GTP酶和Rac相互作用降低。化合物5的 水解产物描绘于图11中。数据表明水解产物#2(化合物12)保留对白血病细胞系的抑制 活性。 实施例6 :化合物OSSK 373747(例如化合物5)的药物动力学 方法
[0128] 测定化合物5即0SSK_373747在小鼠体内的化合物药物动力学。在含有10%的 NMP、5% Cremphor EL、30% PEG200和55% D5W的溶液中制备化合物。分别向雄性C57BL/6 小鼠静脉内(IV)和口服(PO)施用给定的0. 5mg/kg或lmg/kg剂量水平。施用化合物之前, 动物禁食2小时并在给药后4小时允许进食。
[0129] 通过剪尾获得系列血液收集。末梢血液样品在吸入麻醉后经由心脏穿刺收集,并 立即转入湿冰上的K2ETDA管中待离心(于5°C的3200g/10分钟)。收集30分钟内完成离 心。离心后,分离血衆并转移到塑料阵列管(matrix tube)并存放于-80°C等待化学分析。 对于骨髓收集,解剖股骨并在特定的时间点收集骨髓。样品存放于_80°C直到分析。
[0130] 血液和骨髓样品在下列时间点收集:经由IV或PO施用化合物之后0. 0833、0. 25、 0. 5、1、2、3、4、6 和 8 小时。 结果
[0131] 化合物5即0SSK_373747的药物动力学和代谢稳定性示于图10。图IOa是C57/ B16小鼠中0. 5mg/kg IV和lmg/kg PO之后化合物的药物动力学的图示。示出随时间推移 的平均浓度(ng/mL)。图IOb表明的化合物0SSK_373747随时间推移的血浆稳定性。将保 留在血浆中的化合物的百分比随时间作图。图IOc表明随时间推移肝微粒体中化合物的存 在。 实施例7 :二次筛诜:先导化合物的类似物的鉴宙
[0132] 进行二次筛选,其导致对6种另外的化合物(即化合物6-11)的鉴定。图12中的 表格列出了新的化合物和与其为类似物的先导化合物。
[0133] 使用对具有一千九百六十万个商业可获得化合物的Evotec EVO来源数据库的接 近子结构搜索和2D结构相似性,进行对最初的模拟筛选法鉴定的5种先导化合物即化合物 1-5的"最近邻"祀点扩张。用于相似性搜索的相似性阈值被设置为与参考化合物(即化合 物1-5)的0. 6 "Tanimoto"相似性。从搜索得到约20, 000种化合物并且选择与5种先导 化合物最相似的化合物。20, 000种化合物也经受与用于初始模拟筛选相同的Rac蛋白模型 上的生物模拟对接实验。表现出令人信服的对接姿势,与用于虚拟筛选的结合假设一致的 化合物也加入类似物的最终名单。图2显示了 Rac蛋白上5种先导化合物各自的生物模拟 对接。
[0134] 所选的化合物包括与参考靶点结构上高度相似的和也表现出令人信服的对RAC 的对接假设的化合物。特别注意将所选化合物的种类最大化,包括进行"智能"突变,其对 于验证靶点关键功能来说是必须的。
[0135] 为了分析其它们的效力,对这6种类似物在20和80 μ M时对不同细胞系的增殖 抑制进行筛选。图13和14分别显示化合物6-11对SEM的增殖抑制,和化合物3、4、5、6、7、 8和10对MV411细胞的增殖抑制。图15a中的表格显示类似物对下列七种细胞系增殖抑制 的影响的全面观察:REH、SEM、MV411、Jurkat、Raji、Nomo-l和Nalm6。孵育不同时间后,对 两种类似物,化合物6和化合物7,进行下拉测定。下拉分析的结果示于图15b中。也显示 了裂解物中Racl的存在。也显示了化合物NSC23776的下拉分析,其为已知的Racl结合以 及经由Rac-特异性RhoGEF的Rac活化的小抑制剂。图16表明20和80 μ M的从二次筛 选获得的19种化合物存在时SEM细胞的增殖抑制。来自该二次筛选的6种最终的先导化 合物用红色标出。 实施例8 :化合物Τ5602471 (即化合物7)对Raii细朐的剂量晌应分析 方法
[0136] 进一步分析化合物7在不同剂量对Raji白血病细胞系的细胞增殖的影响。在一 定浓度范围内测定化合物对抑制增殖的影响。为了定量细胞增殖的百分比抑制,如上文实 施例2中所述的完成MTS分析。 结果:
[0137] 利用MTS测定定量暴露于化合物7时Raji细胞的增殖抑制。图17显示了暴露于 250ηΜ、500ηΜ、1 μ Μ、5 μ Μ、20 μ M和80 μ M的化合物7之后Raji细胞增殖的百分比抑 制。同样显示化合物NSC23776的结果用于比较。 实施例9 :化合物T5602471 (即化合物7)的药物动力学 方法
[0138] 测定化合物7即T5602471小鼠内的化合物药物动力学。分别向雄性C57BL/6小 鼠静脉内(IV)和口服(PO)施用给定的0. 5mg/kg或lmg/kg剂量水平。根据实施例6的程 序被用来获得化合物7的药物动力学数据。 结果:
[0139] C57/B 16小鼠中0.5mg/kg IV和lmg/kg PO之后化合物7的药物动力学图示示于 图18中。示出随时间推移的每种施用途径的平均浓度(ng/mL)。 实施例10 :化合物T5602471 (即化合物7)的体内耐#件 方法
[0140] 在用经由组成型启动子稳定表达荧光素酶的MV411细胞异种移植的NSG小鼠中评 估化合物7的体内耐受性。在含有10% NMP、5% CremaphorEL、30% PEG200和55% D5W的 溶液中制备化合物7并且以50、100、250或500mg/kg每天的剂量PO施用7天时间。每个 测试组使用五只小鼠。
[0141] 给药时3次/周记录体重。在处理第6天,通过生物发光成像技术将小鼠成像, 以确保异种移植MV411白血病细胞存在。最后剂量,剂量7,之后经下颁下流血采集至少 100 μ L血液用于血浆收集。最后剂量八小时后,进行心脏穿刺取血用于血浆收集。 结果:
[0142] 化合物7的体内耐受性由施用下列浓度范围的所述化合物之后小鼠中的体重和 血浆浓度确定:50、100、250或500mg/kg。图19a显示了对于所测试的每个浓度来说,化合 物的最后剂量施用之后1和8小时,化合物7即T5602471在小鼠血浆中的平均浓度。平均 血楽·浓度以ng/ml和μ M两者显示。
[0143] 图1%显示7天的时间段中以50、100、250或50011^/1^剂量浓度施用化合物7即 Τ5602471的动物的重量。当在所施用的任何剂量都没有观察到进行性体重损失时所述药物 被认为是可耐受的。 实施例11 :Τ5602471 (即化合物7)的 方法
[0144] 进一步分析化合物7即Τ5602471在不同剂量对白血病细胞系SEM、Nomo、RS411、 MV411、Jurket和REH的细胞增殖的影响。测定在一定浓度范围内化合物对这些细胞系的 增殖抑制的影响。化合物7的给药浓度包括250ηΜ、500ηΜ、1μΜ、5μΜ、20μΜ*80μΜ。 测量了以单次剂量和双倍剂量的化合物7的剂量响应和IC5tl。对于单次剂量测定(即1次 加入),将化合物7在铺板时加至细胞。72小时孵育之后,收集细胞并进行剂量响应测定。 可替换地,对于双倍剂量测定(即24小时加入)将化合物7在铺板时加至细胞并且2
4小 时孵育之后将另外的化合物7,以特定的浓度,加至细胞。此外,另外24小时孵育(从细胞 铺板时起48小时)之后将另外的化合物7,以特定的浓度,加至细胞。另外的24小时孵育 (从细胞铺板时起72小时)之后收集细胞并进行剂量响应测定。
[0145] 为了定量细胞增殖的百分比抑制,如上文实施例2中描述的完成MTS分析。 结果:
[0146] 利用MTS测定定量暴露于化合物7时MV411细胞的增殖抑制。图20a显示单次剂 量(即1次加入)和双倍剂量(即24小时加入)暴露于250ηΜ、500ηΜ、1 μ Μ、5μ Μ、20μ M 和80 μ M的化合物7之后,对MV411细胞增殖的百分比抑制。也显示化合物NSC23776的 结果用于比较。图20b显示白血病细胞系SEM、Nomo、RS411、MV411、Jurket和REH中化合 物7的IC5tl,在单次剂量和双倍剂量施用之后测定。 其他的实施方案
[0147] 本说明书中所公开的所有特征可任意组合。本说明书中所公开的每个特征可能被 实现相同、等同或相似目的可替换特征取代。因此,除非另有明确规定,所公开的每个特征 仅为通用系列的等同或相似特征的一个实例。
[0148] 从上面的描述可知,本领域的技术人员可以很容易地确定本发明的本质特征并且 可以进行本发明的各种变化和修改以适应不同用途和条件而不背离其精神和范围。因此, 其它实施方案也在下文权利要求的范围内。
【主权项】
1. 一种药物组合物,包括药学上可接受的载体和式(I)的化合物或其盐:其中 R1' R2、R3、R4、R5、R6、R 7、馬和 R 9中的每一个独立地为 H、C ^Cltl烷基、C ^C1?烯基、C 2-C10 炔基、C3-C2tl环烷基、C3-C2tl环烯基、C「C 2(l杂环烷基、C「C2(l杂环烯基、芳基、杂芳基、卤代、 0Ra、SR a、COORa、OC (O) Ra、C (O) Ra、C (O) NRaRb、S (O) 2NRaRb或 NR Λ,其中艮和 R b中的每一个独 立地为H、C1-Cltl烷基、C 2-C1(#基、C 2-C1Q炔基、C 3-C2Q环烷基、C 3-C2Q环烯基、C「C2Q杂环烷 基、C1-C 2tl杂环烯基、芳基或杂芳基。2. 如权利要求1所述的组合物,其中RpUmRpRjP R9中的每一个独立地 为 HJ1-Ciq 烷基或 NRaRb。3. 如权利要求2所述的组合物,其中R 7为N(CH 3)2。4. 如权利要求3所述的组合物,其中R 2和R 3中的每一个为CH 3。5. 如权利要求4所述的组合物,其中所述化合物为 J--I.6. -种药物组合物,包括药学上可接受的载体和式(II)的化合物或其盐: 其中X是N或CH ; R1、R2、R3、心和R 5中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-(:20环 烷基、C3-C2tl环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「C2(l杂环烯基、芳基、杂芳基、卤代、OR a、SRa、COORa、 OC (0) Ra、C (0) Ra、C (0) NRaRb、S (0) 2NRaRb或 NR aRb; R6、R7、馬和R 9中的每一个独立地为H、C烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-C20环 烷基、C3-C2tl环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「C2(l杂环烯基、芳基、杂芳基、卤代、OR a、SRa、C00Ra、 OC (0) Ra、C (0) Ra、C (0) NRaRb、S (0) 2NRaRb或 NR aRb;或者 R 6和 R 7、&和 R 8,或馬和 R 9,与它们所 连的碳原子一起,为芳基、杂芳基、C3-C2tl环烷基或C ^C2tl杂环烷基; 艮每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1(#基、C 2-C1(l炔基、C 3-C2(l环烷基、C 3-C2(l环烯基、 C1-C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基;并且 Rb每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1(#基、C 2-C1(l炔基、C 3-C2(l环烷基、C 3-C2(l环烯基、 C1-C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基。7. 如权利要求6所述的组合物,其中X是N。8. 如权利要求7所述的组合物,其中R i、R2、R3、R4、R5、R6、R 7、馬和R 9中的每一个独立地 为烷基。9. 如权利要求8所述的组合物,其中R 7为CH 2CH3。10. 如权利要求9所述的组合物,其中所述化合物为11. 如权利要求6所述的组合物,其中X是CH。12. 如权利要求11所述的组合物,其中R 6和R 7,与它们所连的碳原子一起,为1,3-二 氧戊环基团。13. 如权利要求12所述的组合物,其中所述化合物为14. 一种药物组合物,包括药学上可接受的载体和式(III)的化合物或其盐: 其中R1、R2、R3、心和R 5中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-(:20环 烷基、C3-C2tl环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「C2(l杂环烯基、芳基、杂芳基、卤代、OR a、SRa、COORa、 OC (0) Ra、C (0) Ra、C (0) NRaRb、S (0) 2NRaRb或 NR aRb;或 R 丨和 R 2、馬和 R 3、R3和 R 4,或 &和 R 5,与 它们所连的碳原子一起,为芳基、杂芳基、C3-C2tl环烷基或C ^C2tl杂环烷基; R6、R7、R8、R9、Rltl和R n中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、 C3-C2tl环烷基、C 3-C2Q环烯基、C ^C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基、杂芳基、卤代、OR a、SRa、 C00Ra、OC (0) Ra、C (0) Ra、C (0) NRaRb、S (0) 2NRaRb或 NR aRb; Ra中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C2-Cltl炔基、C 3-C2Q环烷基、C 3-(:20环 烯基、C1-C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基;并且 Rb中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-C2Q环烷基、C 3-(:20环 烯基、C1-C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基。15. 如权利要求14所述的组合物,其中R 3和R 4中的每一个是H ;或者R 3和R 4,与它们 所连的碳原子一起,为苯基或1,4-二氧六环基团。16. 如权利要求15所述的组合物,其中R i、R2、R5、R6、R7、R8、R 9、Rltl和R η中的每一个独 立地为H、C1-Cltl烷基或卤代。17. 如权利要求16所述的组合物,其中R 1是瓜Cl或CH 3;1?2是H或Cl ;并且R H^PR11 中的每一个为CH3。18. 如权利要求17所述的组合物,其中所述化合物为19. 一种药物组合物,包括药学上可接受的载体和式(IV)的化合物或其盐:其中 R1、R2、R3、心和R 5中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-(:20环 烷基、C3-C2tl环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「C2(l杂环烯基、芳基、杂芳基、卤代、OR a、SRa、COORa、 OC (0) Ra、C (0) Ra、C (0) NRaRb、S (0) 2NRaRb或 NR aRb;或 R 丨和 R 2、馬和 R 3、R3和 R 4,或 &和 R 5,与 它们所连的碳原子一起,为芳基、杂芳基、C3-C2tl环烷基或C ^C2tl杂环烷基; R6、R7、R8、R9、R1(l、R 11和 R 12 中的每一个独立地为 H、C「C1(l烷基、C 2-C1(l烯基、C 2-C1(l炔基、 C3-C2tl环烷基、C 3-C2Q环烯基、C ^C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基、杂芳基、卤代、OR a、SRa、 C00Ra、OC (0) Ra、C (0) Ra、C (0) NRaRb、S (0) 2NRaRb或 NR aRb; Ra中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C2-Cltl炔基、C 3-C2Q环烷基、C 3-C2Q环 烯基、C1-C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基; Rb中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-C2Q环烷基、C 3-C2Q环 烯基、C1-C2tl杂环烷基、C ^c2tl杂环烯基、芳基或杂芳基。20. 如权利要求19所述的组合物,其中R i、R2、R6、R7、R8、R9、R 1Q、R1JP R 12中的每一个独 立地为H、C1-Cltl烷基或卤代。21. 如权利要求20所述的组合物,其中R 1(|是F。22. 如权利要求21所述的组合物,其中R 7是CH 3。23. 如权利要求22所述的组合物,其中R 3、&和R 5中的每一个独立地为H或 S (O) 2N(CH3) 2;或者R 3和R4,与它们所连的碳原子一起,为1,3-二氧戊环基团;或者&和R5, 与它们所连的碳原子一起,为吡唑基。24. 如权利要求23所述的组合物,其中所述化合物为25. -种药物组合物,包括药学上可接受的载体和式(V)的化合物或其盐: 其中Rp R2、R3、R4、R5、R6、R 7、R8、馬和R 1Q中的每一个独立地为H、任选地由芳基取代的C ^Cici 烷基、C2-Cjt基、C 2-C1(l炔基、C 3-C2(l环烷基、C 3-C2(l环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「C2(l杂环烯 基、芳基、杂芳基、卤代、0艮、5艮、〇)01^、0(:(0)1^、(:(0)1^、(:(0)殿3 13、5(0)2殿凡或顺义,其 中艮和R b中的每一个独立地为H、C ^Cltl烷基、C 2-C1Q烯基、C 2-C1Q炔基、C 3-C2Q环烷基、C 3-C20 环烯基、C1-C2tl杂环烷基、C ^C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基。26. 如权利要求25所述的组合物,其中R r R2、R3、R4、R5、R6、R 7、R8、馬和R 1Q中的每一个 独立地为H、OH、Cl或任选地由芳基取代的C1-Cltl烷基。27. 如权利要求26所述的组合物,其中R 1(|为由苯基取代的甲基。28. 如权利要求27所述的组合物,其中RjPR5中的每一个独立地为H、Cl或0H。29. 如权利要求28所述的组合物,其中所述化合物为30. -种药物组合物,包括药学上可接受的载体和式(VI)的化合物或其盐: 其中R1、R2、R3、&和R 5中的每一个独立地为H、任选地由芳基取代的C ^Cltl烷基、C 2-C1(l烯基、 C2-Cltl炔基、c 3-c2(l环烷基、c 3-c2(l环烯基、C「C2(l杂环烷基、C「c2(l杂环烯基、芳基、杂芳基、卤 代、0Ra、SRa、COORa、OC (O) Ra、C (O) Ra、C (O) NRaRb、S (O) 2NRaRb或 NR Λ,其中 RjP R b中的每一 个独立地为扎(:1-(:1(|烷基、(:2-(:1(|烯基、(: 2-(:1(|炔基、(:3-(:2(|环烷基、(: 3-(:2(|环烯基、(:1-(:2(|杂环 烷基、C1-C2tl杂环烯基、芳基或杂芳基。31. 如权利要求30所述的组合物,其中R i、R2、R3、&和R 5中的每一个独立地为H或任 选地由芳基取代的C1-Cltl烷基。32. 如权利要求31所述的组合物,其中R 5是由苯基取代的甲基。33. 如权利要求32所述的组合物,其中所述化合物是34. -种用于在受试者中治疗Rac-GTP酶介导的病症的方法,包括向有需要的所述受 试者施用有效量的如权利要求1至33中任一项所述的药物组合物。35. 如权利要求34所述的方法,其中所述Rac-GTP酶介导的病症是癌症。36. 如权利要求35所述的方法,其中所述癌症是白血病。37. 如权利要求36所述的方法,其中癌症是幼儿急性淋巴细胞白血病。38. 如权利要求34所述的方法,其中所述Rac-GTP酶介导的病症是炎性病症。39. 如权利要求34所述的方法,其中所述Rac-GTP酶介导的病症是骨吸收障碍。40. 如权利要求1至33中任一项所述的药物组合物在用于治疗Rac-GTP酶介导的病症 的药物的制造中的用途。
【专利摘要】本发明涉及通过定量的高通量测定鉴定为在慢性粒细胞性白血病的治疗中有效的包括某些化合物的组合物,以及制造这些化合物的方法以及这些化合物用于治疗Rac-GTP酶介导的病症的用途。
【IPC分类】A61K31/497, A61K31/4184, A61K31/495, A61P19/00, A61K31/4162, A61P29/00, A61P35/00
【公开号】CN104884061
【申请号】CN201380063868
【发明人】D·A·威廉姆斯
【申请人】儿童医疗中心公司
【公开日】2015年9月2日
【申请日】2013年10月11日
【公告号】CA2887699A1, EP2908813A1, US20150265608, WO2014059305A1
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