温度敏感型载体pBBR1MCS-2-Ts3及其应用
【技术领域】
[0001] 本发明涉及生物技术领域中温度敏感型载体PBBR1MCS-2-TS3及其应用。
【背景技术】
[0002] 把一段有用的目的DNA片段通过DNA重组技术,送进受体细胞中去进行复制和表 达的工具叫载体(Vector)。质粒是重组DNA技术中常用的载体,质粒存在于许多细菌以及 酵母菌等生物中,是细胞染色体外能够自主复制的很小的环状DNA分子。一个理想的载体 大致应有下列一些特性:(1)分子量小、多拷贝、松弛控制型;(2)具有多种常用的限制性内 切酶的单切点;(3)能插入较大的外源DNA片段;(4)具有遗传标记,便于鉴定和筛选;(5) 对宿主细胞无害。
[0003] 宽宿主质粒pBBRlMCS-2是应用性很广的载体,该质粒由pBBRl质粒改造而来。 pBBRl 质粒来源于革兰氏阴性菌 Bordetella bronchiseptica S87 (Antoine R and Locht C. Isolation and molecular characterization of a novel broad-host-range plasmid from Bordetella bronchiseptica with sequence similarities to plasmids from Gram-positive organisms. Mol Microbiol. 1992, 6 (13) : 1785-1799)。pBBRlMCS-2 含有一 个卡那霉素(kan)抗性筛选标记,它的大小仅有5145bp,这些特性使得该质粒适用于DNA克 隆、蛋白表达,广泛用于革兰氏阴性菌的分子操作。
[0004] 温度敏感型质粒载体可以方便的控制质粒在宿主中的存在。当温度比较低时,质 粒可以存在宿主中,而当温度提高后,温度敏感型质粒载体将丢失或整合到染色体上。
【发明内容】
[0005] 本发明所要解决的技术问题是如何构建温度敏感型载体。
[0006] 为解决上述技术问题,本发明首先提供了构建重组载体的方法。
[0007] 本发明所提供的构建重组载体的方法,为构建重组载体的方法1,是将SEQ ID No. 1的第1557-2526位所示的DNA片段替换为目的基因表达盒,并保持SEQ ID No. 1的其 他核苷酸不变,得到的重组DNA即为所述重组载体,将该重组载体命名为pBBRlMCS-2-Ts3 ;
[0008] 所述目的基因表达盒编码的蛋白质为将SEQ ID No. 2所示的蛋白质进行A3)的改 造、保持SEQ ID No. 2的其它氨基酸残基均不变得到的蛋白质得到的蛋白质,即所述目的 基因表达盒编码的蛋白质为SEQ ID No. 8所示的蛋白质;A3)为将SEQ ID No. 2第86位的 Arg突变为Cys。
[0009] 上述方法1中,所述目的基因表达盒中的目的基因为将SEQ ID No. 1的第 1794-2456位核苷酸所示的DNA分子进行B3)的改造、保持SEQ ID No. 1的第1794-2456位 核苷酸所示的DNA分子中的其它核苷酸均不变得到的DNA分子;B3)为将SEQ ID No. 1第 2049位的C突变为T。
[0010] 其中,SEQ ID No. 1由5145个核苷酸组成,SEQ ID No. 1的第1794-2456位核苷酸 为rep的编码基因,编码SEQ ID No. 2所示的rep蛋白。
[0011] 上述方法1中,所述目的基因表达盒的序列可为SEQ ID No. 7。
[0012] 其中,SEQ ID No. 7的第238-900位编码SEQ ID No. 8所示的蛋白质。
[0013] 上述方法1中,所述目的基因表达盒中启动所述目的基因表达的启动子为将SEQ ID No. 1的第1557-1793位所示的DNA分子进行如下C2)、C3)和C4)这三种中至少一种的 改造、保持SEQ ID No. 1的第1557-1793位核苷酸所示的DNA分子中的其它核苷酸均不变 得到的DNA分子:
[0014] C2)如下 C21)和 / 或 C22):
[0015] C21)将 SEQ ID No. 1 第 1732 位的 A 突变为 G ;
[0016] C22)将 SEQ ID No. 1 第 1780 位的 G 突变为 T ;
[0017] C3)如下 C31)和 / 或 C32):
[0018] C31)将 SEQ ID No. 1 第 1747 位的 C 突变为 T ;
[0019] C32)将 SEQ ID No. 1 第 1776 位的 T 突变为 A ;
[0020] C4)将 SEQ ID No. 1 第 1751 位的 T 突变为 A ;
[0021] 所述目的基因表达盒中终止所述目的基因表达的终止子为SEQ ID No. 1的第 2457-2526位所示的DNA分子。
[0022] 为解决上述技术问题,本发明还提供了构建重组载体的方法。
[0023] 本发明所提供的构建重组载体的方法,为构建重组载体的方法2,是将SEQ ID No. 1的第1557-2526位所示的DNA片段替换为目的基因表达盒,并保持SEQ ID No. 1的其 他核苷酸不变,得到的重组DNA即为所述重组载体;
[0024] 所述基因表达盒中的基因编码的蛋白质为将SEQ ID No. 2所不的蛋白质进行所述 A3)和下述A4)的改造、保持SEQ ID No. 2的其它氨基酸残基均不变得到的蛋白质得到的蛋 白质:
[0025] A4)如下 A41)和 / 或 A42):
[0026] A41)将 SEQ ID No. 2 第 25 位的 Lys 突变为 Glu ;
[0027] A42)将 SEQ ID No. 2 第 146 位的 Ile 突变为 Val。
[0028] 上述方法2中,所述目的基因表达盒中的目的基因为将SEQ ID No. 1的第 1794-2456位核苷酸所示的DNA分子进行所述B3)和下述M)的改造、保持SEQ ID No. 1的 第1794-2456位核苷酸所示的DNA分子中的其它核苷酸均不变得到的DNA分子:
[0029] B4)如下 B41)和 / 或 B42):
[0030] B41)将 SEQ ID No. 1 第 1866 位的 A 突变为 G ;
[0031] B42)将 SEQ ID No. 1 第 2229 位的 A 突变为 G。
[0032] 上述方法2中,所述目的基因表达盒中启动所述目的基因表达的启动子为将SEQ ID No. 1的第1557-1793位所示的DNA分子进行所述C2)、所述C3)和所述C4)这三种中至 少一种的改造、保持SEQ ID No. 1的第1557-1793位核苷酸所示的DNA分子中的其它核苷 酸均不变得到的DNA分子;
[0033] 所述基因表达盒中终止所述基因表达的终止子为SEQ ID No. 1的第2457-2526位 所示的DNA分子。
[0034] 为解决上述技术问题,本发明还提供了由所述方法1或所述方法2构建的重组载 体。
[0035] 为解决上述技术问题,本发明还提供了含有所述重组载体的重组微生物或重组细 胞系。
[0036] 所述重组微生物具体可为细菌、酵母、藻和真菌。其中,所述细菌可为大肠杆 菌或类球红细菌。所述大肠杆菌具体可为大肠杆菌Escherichia coli T1、大肠杆菌 Escherichia coli DH5a、大肠杆菌 Escherichia coli BW25113 或大肠杆菌 Escherichia coli S17-1。所述类球红细菌具体可为类球红细菌Rhodobacter sphaeroides 2. 4.1。
[0037] 所述重组细胞系不包括繁殖材料。
[0038] 为解决上述技术问题,本发明还提供了下述任一产品:
[0039] Pl、所述蛋白质;
[0040] P2、所述目的基因;
[0041] P3、DNA分子,为将SEQ ID No. 1的第1557-1793位所示的DNA分子进行所述C3) 或下述Z34)的改造、保持SEQ ID No. 1的第1557-1793位核苷酸所示的DNA分子中的其它 核苷酸均不变得到的DNA分子;
[0042] Z34)为所述C3)和所述C4)。
[0043] 为解决上述技术问题,本发明还提供了下述任一应用:
[0044] L1、所述目的基因或所述DNA分子在制备温度敏感载体中的应用;
[0045] L2、所述DNA分子在作为启动子中的应用;
[0046] L3、所述重组载体在作为温度敏感载体中的应用。
[0047] 上述L3所述应用可为所述重组载体在大肠杆菌或类球红细菌中作为温度敏 感载体中的应用。所述大肠杆菌具体可为大肠杆菌Escherichia coli T1、大肠杆菌 Escherichia coli DH5a、大肠杆菌 Escherichia coli BW25113 或大肠杆菌 Escherichia coli S17-1。所述类球红细菌具体可为类球红细菌Rhodobacter sphaeroides 2. 4.1。
[0048] 本申请中,所述温度敏感载体为所述载体在一定温度下可存在于宿主中,而改变 温度后,所述载体不能存在于所述宿主中。具体可为所述载体在30°C下可存在于宿主中,当 温度为37°C -42°C时,所述载体不能存在于所述宿主中。
[0049] 实验证明,本发明的重组载体PBBRlMCS-2-Ts3为温度敏感载体:在宿主菌 分别为大肠杆菌Escherichia coli T1、大肠杆菌Escherichia coli DH5a、大肠杆 菌 Escherichia coli BW25113 和大肠杆菌 Escherichia coli S17-1 时,pBBRlMCS-2 和pBBRlMCS-2-Ts3在30°C LB液体培养基和30°C LB+kan液体培养基中的丢失率以及 pBBRlMCS-2在42°C LB液体培养基中的丢失率均在10%以下,而pBBRlMCS-2-Ts3在42°C LB 液体培养基中的丢失率均达到99. 99%;在宿主菌为类球红细菌Rhodobacter sphaeroides 2. 4. 1 时,pBBRlMCS-2 和 pBBRlMCS-2-Ts3 在 30°C LB 液体培养基和 30°C LB+kan 液体培 养基中的丢失率以及PBBR1MCS-2在37°C LB液体培养基中的丢失率均在13 %以下,而 pBBRlMCS-2-Ts3在37°C LB液体培养基中的丢失率均达到80. 53%。
[0050] 实验证明,本发明的重组载体PBBRlMCS-2-Ts3为温度敏感载体可应用于:(1)载 体消除,即通过提高温度移去载体;(2)单交换同源重组,即通过提高温度,让载体DNA整合 到染色体的同源区域;(3)双交换同源重组,即通过提高温度,让载体DNA替换染色体上一 段 DNA。
【附图说明】
[0051] 图 1 为 pBBRlMCS-2 的图谱。
【具体实施方式】
[0052] 下面结合【具体实施方式】对本发明进行进一步的详细描述,给出的实施例仅为了阐 明本发明,而不是为了限制本发明的范围。
[0053] 下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。
[0054] 下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
[0055] 下述实施例中的宽宿主载体pBBRlMCS-2为Biovector中国质粒载体菌株细胞株 基因保藏中心产品。
[0056] 下述实施例中的大肠杆菌Escherichia coli Tl为北京全式金生物技术有限公司 产品,目录号为CD501-01。
[0057] 下述实施例中的大肠杆菌Escherichia coli
DH5 α为宝生物工程(大连)有限 公司,目录号为9057。
[0058] 下述实施例中的大肠杆菌Escherichia coli BW25113为Biovector中国质粒载 体菌株细胞株基因保藏中心产品。
[0059] 下述实施例中的大肠杆菌Escherichia coli S17-1为Biovector中国质粒载体 菌株细胞株基因保藏中心产品。
[0060] 下述实施例中的类球红细菌Rhodobacter sphaeroides 2. 4. 1为美国模式菌种收 集中心(ATCC)产品,菌株号为17023。
[0061] 下述实施例中的Sistrom培养基在文献(Sistrom WR. The kinetics of the synthesis of photopigments in Rhodopseudomonas sphaeroides. J.Gen. Microbiol. 1962.28:607-616)中报道过。
[0062] 下述实施例中的LB液体培养基为由溶质和溶剂组成无菌培养基,溶剂为水,溶质 及其浓度分别为胰蛋白胨lg/l〇〇mL,酵母浸粉0. 5g/100mL,NaCl 0. 5g/100mL ;
[0063] LB+kan液体培养基为向LB液体培养基中加入卡那霉素得到的无菌培养基, LB+kan液体培养基中卡那霉素的含量为50mg/L ;
[0064] LB平板为向LB液体培养基中加入琼脂得到的无菌固体培养基;
[0065] LB+kan平板为向LB液体培养基中加入琼脂和卡那霉素得到的无菌固体培养基, LB+kan平板中卡那霉素的含量为50mg/L。
[0066] 实施例1、温度敏感载体的制备
[0067] 1、温度敏感载体的筛选
[0068] 对宽宿主载体pBBRlMCS-2(图1)中SEQ ID No. 1的第1557-2526位所示的DNA 片段进行随机突变,得到多条不同随机突变的突变后的DNA分子;将pBBRlMCS-2中SEQ ID No. 1的第1557-2526位所示的DNA片段分别替换为上述各突变后的DNA分子,保持 pBBRlMCS-2的其他序列不变,得到多个含有突变DNA片段的重组载体;将这些含有突变DNA 片段的重组载体分别导入大肠杆菌Escherichia coli Tl中,得到1068个含有突变DNA片 段的重组大肠杆菌。将pBBRlMCS-2导入大肠杆菌Escherichia coli Tl中,得到重组大肠 杆菌 Tl (pBBRlMCS-2)。
[0069] 其中,SEQ ID No. 1的第1794-2456位核苷酸编码SEQ ID No. 2所示的r印蛋白。 [0070] 对上述含有突变DNA片段的重组大肠杆菌按照下述方法进行筛选,并将 Tl (PBBR1MCS-2)作为对照:将这1068个重组大肠杆菌中的每个重组大肠杆菌的同 一克隆分别进行①和②的处理:①将重组大肠杆菌接种至LB平板上,于42 °C下培养 18h,然后将LB平板上42°C下长出的重组大肠杆菌接种至LB+kan平板上,于42°C下 培养18h;②将重组大肠杆菌接种至LB+kan平板上,于30°C下培养18h。对比42°C 和30 °C下的LB+kan的平板,发现有4株重组大肠杆菌在30 °C下的LB+Kan平板上生 长正常,但在42°C下的LB+Kan平板上不能生长(表1),而Tl(pBBRlMCS-2)在30°C下 的LB+Kan平板与42°C下的LB+Kan平板上均能正常生长,表明,这4株重组大肠杆菌对 温度敏感。将这4株重组大肠杆菌中从pBBRlMCS-2突变而来的重组载体分别命名为 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4,将对应的重组大 肠杆菌分别命名为 Tl (pBBRlMCS-2-Tsl)、Tl (pBBRlMCS-2-Ts2)、Tl (pBBRlMCS-2-Ts3)和 Tl (pBBRlMCS-2-Ts4)。
[0071] 表1、重组大肠杆菌的筛选
[0072]
[0073] 提取 Tl (pBBRlMCS-2-Tsl)、Tl (pBBRlMCS-2-Ts2)、Tl (pBBRlMCS-2-Ts3)和 Tl(pBBRlMCS-2-Ts4)中的 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 质粒,分别对 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4对应于SEQ ID No. 1的第1557-2526位核苷酸所示的DNA片段进行测序, 发现:
[0074] pBBRlMCS-2-Tsl 为将 pBBRlMCS-2 进行如下 B11)、B12)、B13)和 B14)的改造并保 持pBBRlMCS-2的其他序列不变得到的重组载体,pBBRlMCS-2-Tsl的第1557-2526位核苷 酸序列为SEQ ID No. 3 :
[0075] BI 1)将 SEQ ID No. 1 第 1827 位的 G 突变为 A ;
[0076] B12)将 SEQ ID No. 1 第 2034 位的 G 突变为 C ;
[0077] B13)将 SEQ ID No. 1 第 2212 位的 A 突变为 T ;
[0078] B14)将 SEQ ID No. 1 第 2249 位的 C 突变为 A。
[0079] pBBRlMCS-2-Ts2 为将 pBBRlMCS-2 进行如下 B2)、C21)和 C22)的改造并保持 pBBRlMCS-2的其他序列不变得到的重组载体,pBBRlMCS-2-Ts2的第1557-2526位核苷酸序 列为 SEQ ID No. 5 :
[0080] B2)将 SEQ ID No. 1 第 2183 位的 C 突变为 G ;
[0081] C21)将 SEQ ID No. 1 第 1732 位的 A 突变为 G ;
[0082] C22)将 SEQ ID No. 1 第 1780 位的 G 突变为 T ;
[0083] pBBRlMCS-2-Ts3 为将 pBBRlMCS-2 进行如下 B3)、C31)和 C32)的改造并保持 pBBRlMCS-2的其他序列不变得到的重组载体,pBBRlMCS-2-Ts3的第1557-2526位核苷酸序 列为 SEQ ID No. 7 :
[0084] B3)为将 SEQ ID No. 1 第 2049 位的 C 突变为 T ;
[0085] C31)将 SEQ ID No. 1 第 1747 位的 C 突变为 T ;
[0086] C32)将 SEQ ID No. 1 第 1776 位的 T 突变为 A ;
[0087] pBBRlMCS-2-Ts4 为将 pBBRlMCS-2 进行如下 B41)、B42)和 C4)的改造并保持 pBBRlMCS-2的其他序列不变得到的重组载体,pBBRlMCS-2-Ts4的第1557-2526位核苷酸序 列为 SEQ ID No. 9 :
[0088] B41)将 SEQ ID No. 1 第 1866 位的 A 突变为 G ;
[0089] B42)将 SEQ ID No. 1 第 2229 位的 A 突变为 G ;
[0090] C4)将 SEQ ID No. 1 第 1751 位的 T 突变为 A。
[0091] 表明,与 pBBRlMCS-2 相比,pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4均发生了部分核苷酸的突变。
[0092] 在 1068 个重组大肠杆菌中除 Tl (pBBRlMCS-2-Tsl)、Tl (pBBRlMCS-2-Ts2)、 Tl (pBBR1MCS-2-Ts3)和 Tl (pBBR1MCS-2-Ts4)外的重组大肠杆菌(在 30°C 下的 LB+Kan 平 板与42°C下的LB+Kan平板上均能正常生长,即对温度不敏感的重组大肠杆菌)中随机选 取10株,对这10株中从pBBRlMCS-2突变而来的重组载体进行测序,结果发现,这10株对 温度不敏感的重组大肠杆菌中从PBBR1MCS-2突变而来的重组载体也均发生了部分核苷酸 的突变。
[0093] 与pBBRlMCS-2相比,pBBRlMCS-2-Tsl的第1794-2456位核苷酸编码的蛋白质(氨 基酸序列为SEQ ID No. 4)为将SEQ ID No. 2所示的蛋白质进行如下All)、A12)和A13)的 改造得到的蛋白质:
[0094] All)将 SEQ ID No. 2 第 12 位的 Ala 突变为 Thr ;
[0095] A12)将 SEQ ID No. 2 第 81 位的 Asp 突变为 His ;
[0096] A13)将 SEQ ID No. 2 第 140 位的 His 突变为 Leu。
[0097] 与pBBRlMCS-2相比,pBBRlMCS-2-Ts2的第1794-2456位核苷酸编码的蛋白质(氨 基酸序列为SEQ ID No. 6)为将SEQ ID No. 2所示的蛋白质进行如下A2)的改造得到的蛋 白质:A2)为将SEQ ID No. 2第130位的His突变为Gin。
[0098] 与pBBRlMCS-2相比,pBBRlMCS-2-Ts3的第1794-2456位核苷酸编码的蛋白质(氨 基酸序列为SEQ ID No. 8)为将SEQ ID No. 2所示的蛋白质进行如下A3)的改造得到的蛋 白质:A3)为将SEQ ID No. 2第86位的Arg突变为Cys。
[0099] 与pBBRlMCS-2相比,pBBRlMCS-2-Ts4的第1794-2456位核苷酸编码的蛋白质(氨 基酸序列为SEQ ID No. 10)为将SEQ ID No. 2所示的蛋白质进行如下A41)和A42)的改造 得到的蛋白质:
[0100] A41)将 SEQ ID No. 2 第 25 位的 Lys 突变为 Glu ;
[0101] A42)将 SEQ ID No. 2 第 146 位的 Ile 突变为 Val。
[0102] 2、pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 温度敏 感性的验证
[0103] 将步骤1的Tl (pBBRlMCS-2-Tsl)接种至LB+kan液体培养基中,于30°C培养18小 时,将得到的菌液进行以下处理:
[0104] ①将菌液按I :1000的比例接种至3mL LB液体培养基中,然后于30°C下培养18小 时,得到LB-30°C菌液;将LB-30°C菌液稀释后得到LB-30°C稀释菌液,将LB-30°C稀释菌液 分别涂布至LB平板和LB+kan平板上,每个平板100 μ L LB-30°C稀释菌液,然后于30°C下 培养18小时,分别得到LB-LB-30°C平板和LB-LB+kan-30°C平板,统计LB-LB-30°C平板和 LB-LB+kan-30°C平板上的菌落数,计算得到重组载体pBBRlMCS-2-Tsl在30°C LB液体培养 基中的丢失率(表2),载体的丢失率=(LB-LB-30°C平板上的菌落数一 LB-LB+kan-30°C平 板上的菌落数)+LB-LB-30°C平板上的菌落数;
[0105] ②将菌液按I :1000的比例接种至3mL LB+kan液体培养基中,然后于30°C下培 养18小时,得到LB+kan-30 °C菌液;将LB+kan-30 °C菌液稀释后得到LB+kan-30 °C稀释 菌液,将LB+kan-30°C稀释菌液分别涂布至LB平板和LB+kan平板上,每个平板100 μ L LB+kan-30 °C稀释菌液,然后于30 °C下培养18小时,分别得到LB+kan-LB-30 °C平板和 LB+kan_LB+kan_30
°C 平板,统计 LB+kan_LB_30°C 平板和 LB+kan_LB+kan_30°C 平板上的菌 落数,计算得到重组载体pBBRlMCS-2-Tsl在30°C LB+kan液体培养基中的丢失率(表2), 载体的丢失率=(LB+kan-LB-30°C平板上的菌落数一 LB+kan-LB+kan-30°C平板上的菌落 数)+ LB+kan-LB-30°C平板上的菌落数;
[0106] ③将菌液按I :1000的比例接种至3mL LB液体培养基中,然后于42°C下培养18小 时,得到LB-42°C菌液;将LB-42°C菌液稀释后得到LB-42°C稀释菌液,将LB-42°C稀释菌液 分别涂布至LB平板和LB+kan平板上,每个平板100 μ L LB-42°C稀释菌液,然后于42°C下 培养18小时,分别得到LB-LB-42°C平板和LB-LB+kan-42°C平板,统计LB-LB-42°C平板和 LB-LB+kan-42°C平板上的菌落数,计算得到重组载体pBBRlMCS-2-Tsl在42°C LB液体培养 基中的丢失率(表2),载体的丢失率=(LB-LB-42°C平板上的菌落数一 LB-LB+kan-42°C平 板上的菌落数)+LB-LB-42°C平板上的菌落数。
[0107] 按照上述方法,将 Tl(pBBRlMCS-2-Tsl)替换为 Tl(pBBRlMCS-2-Ts2)、 Tl (pBBRlMCS-2-Ts3)、Tl (pBBRlMCS-2-Ts4)和 Tl (pBBRlMCS-2),其他步骤均不变,得到重 组载体 pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3、pBBRlMCS-2-Ts4 和 pBBRlMCS-2 分别在 30°C LB 液体培养基、30 °C LB+kan液体培养基和42 °C LB液体培养基中的丢失率(表2)。
[0108] 表2、重组载体在不同温度下的丢失率
[0109]
[0110] 上述 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBR1MCS-2-Ts2、pBBR1MCS-2-Ts3 和 pBBR1MCS-2-Ts4 在30 °C LB液体培养基中的丢失率在8. 70% -9. 62%间,在30 °C LB+kan液体培养基中 的丢失率在4. 44% -7. 84%间,而在42°C LB液体培养基中的丢失率均达99. 99%,而 口881?1]\?^-2在这三种液体培养基中的丢失率在4.76%-9.80%间,说明?881?1]\?^-2-了81、 pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 均为温度敏感型载体。
[0111] 实施例 2、pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在大肠杆菌Escherichia coli DH5a中的温度敏感性
[0112] 分别将 pBBRlMCS-2 及实施例 1 步骤 1 的 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、 pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 分别导入大肠杆菌 Escherichia coli DH5 a 中,分别得到重组大肠杆菌 DH5a (pBBRlMCS-2)、DH5a (pBBRlMCS-2-Tsl)、 DH5 a (pBBRlMCS-2-Ts2)、DH5 a (pBBRlMCS-2-Ts3)和 DH5 a (pBBRlMCS-2-Ts4)。
[0113] 按照实施例1步骤2的方法,将Tl(pBBRlMCS-2-Tsl)分别替换为上 述 DH5a (pBBRlMCS-2)、DH5a (pBBRlMCS-2-Tsl)、DH5a (pBBRlMCS-2-Ts2)、 DH5 a (pBBRlMCS-2-Ts3)和DH5 a (pBBRlMCS-2-Ts4),其他步骤均不变,分别得到宿主 菌为大肠杆菌 Escherichia coli DH5a 时重组载体 pBBRlMCS-2、pBBRlMCS-2-Tsl、 pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 分别在 30 °C LB 液体培养基、 30°C LB+kan液体培养基和42°C LB液体培养基中的丢失率(表3)。
[0114] 表3、温度敏感型载体在大肠杆菌Escherichia coli DH5a中的丢失率
[0115]
[0116] 在宿主菌为大肠杆菌Escherichia coli DH5a 时,pBBRlMCS-2、pBBRlMCS-2-Tsl、 pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在 30°C LB 液体培养基和 30°C LB+kan 液体培养基中的丢失率以及口881?11?^-2在42°〇1^液体培养基中的丢失率均在10%以下, pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在 42°C LB 液体培 养基中的丢失率均达到 99. 99%,说明 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和pBBRlMCS-2-Ts4在大肠杆菌Escherichia coli DH5a中均可表现出其温度敏感性。
[0117] 实施例 3、pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在大肠杆菌Escherichia coli BW25113中的温度敏感性
[0118] 分别将 pBBRlMCS-2 及实施例 1 步骤 1 的 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、 pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 分别导入大肠杆菌 Escherichia coli BW25113 中,分别得到重组大肠杆菌 BW25113(pBBRlMCS-2)、BW25113(pBBRlMCS-2-Tsl)、 BW25113(pBBRlMCS-2-Ts2)、BW25113(pBBRlMCS-2-Ts3)和 BW25113(pBBRlMCS-2-Ts4)。
[0119] 按照实施例1步骤2的方法,将Tl (pBBRlMCS-2-Tsl)分别替换为上述 BW25113(pBBRlMCS-2)、BW25113 (pBBRlMCS-2-Tsl)、BW25113 (pBBRlMCS-2-Ts2)、 BW25113(pBBRlMCS-2-Ts3)和 BW25113(pBBRlMCS-2-Ts4),其他步骤均不变,分别得到宿 主菌为大肠杆菌 Escherichia coli BW25113 时重组载体 pBBRlMCS-2、pBBRlMCS-2-Tsl、 pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 分别在 30 °C LB 液体培养基、 30°C LB+kan液体培养基和42°C LB液体培养基中的丢失率(表4)。
[0120] 表4、温度敏感型载体在大肠杆菌Escherichia coli BW25113中的丢失率
[0121]
[0123] 在宿主菌为大肠杆菌 Escherichia coli BW25113 时,pBBRlMCS-2、 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在 30 °C LB 液 体培养基和30°C LB+kan液体培养基中的丢失率以及pBBRlMCS-2在42°C LB液体培养 基中的丢失率均在10%以下,口831?1]\?^-2-了81、口881?1]\?^-2-了82、口881?1]\?^-2-了83和 pBBRlMCS-2-Ts4在42°C LB液体培养基中的丢失率均达到99. 99%,说明pBBRlMCS-2-Tsl、 pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在大肠杆菌 Escherichia coli BW25113中均可表现出其温度敏感性。
[0124] 实施例 4、pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在大肠杆菌Escherichia coli S17-1中的温度敏感性
[0125] 分别将 pBBRlMCS-2 及实施例 1 步骤 1 的 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、 pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 分别导入大肠杆菌 Escherichia coli S17-1 中,分别得到重组大肠杆菌 S17-l(pBBRlMCS-2)、S17-l(pBBRlMCS-2-Tsl)、 S17-1(pBBRlMCS-2-Ts2)、S17-1 (pBBRlMCS-2-Ts3)和 S17-1 (pBBRlMCS-2-Ts4)。
[0126] 按照实施例1步骤2的方法,将Tl(pBBRlMCS-2-Tsl)分别替换为上 述 S17-1 (pBBRlMCS-2)、S17-1(pBBRlMCS-2-Tsl)、S17-1 (pBBRlMCS-2-Ts2)、 S17-1 (pBBRlMCS-2-Ts3)和 S17-1 (pBBRlMCS-2-Ts4),其他步骤均不变,分别得到宿主 菌为大肠杆菌 Escherichia coli S17-1 时重组载体 pBBRlMCS-2、pBBRlMCS-2-Tsl、 pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 分别在 30 °C LB 液体培养基、 30°C LB+kan液体培养基和42°C LB液体培养基中的丢失率(表5)。
[0127] 表5、温度敏感型载体在大肠杆菌Escherichia coli S17-1中的丢失率
[0128]
[0130] 在宿主菌为大肠杆菌Escherichia coli S17-1 时,pBBRlMCS-2、pBBRlMCS-2-Tsl、 pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在 30°C LB 液体培养基和 30°C LB+kan 液体培养基中的丢失率以及口881?11?^-2在42°〇1^液体培养基中的丢失率均在10%以下, pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在 42°C LB 液体培 养基中的丢失率均达到 99. 99%,说明 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和pBBRlMCS-2-Ts4在大肠杆菌Escherichia coli S17-1中均可表现出其温度敏感性。
[0131] 实施例 5、pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在类球红细菌Rhodobacter sphaeroides 2. 4. 1中的温度敏感性
[0132] 1、重组类球红细菌的制备
[0133] (1)将实施例4的重组大肠杆菌S17-l(pBBRlMCS-2)在LB+kan液体培养基中37°C 摇瓶过夜培养,次日以1/10的转接量转接至新鲜的LB液体培养基,继续培养约1-2小时至 0D600 为 I. 0 左右,得到 S17-1 (pBBRlMCS-2)培养液;取 I. 5mL S17-1 (pBBRlMCS-2)培养液 7000rpm下离心3-5分钟,弃上清液,得到菌体沉淀,用新鲜的LB培养基洗涤菌体沉淀2次, 用200 μ L LB液体培养基重悬菌体沉淀,得到供体菌悬浮液;
[0134] (2)将类球红细菌Rhodobacter sphaeroides 2. 4. 1在LB液体培养基中30°C下 培养24小时后转接至新鲜的LB培养基继续培养约24小时至0D600为1. 7-2. 5左右,得到 类球红细菌培养液;取I.
5mL类球红细菌培养液7000rpm下离心3-5分钟,弃上清液,得到 菌体沉淀,用新鲜的LB培养基洗涤菌体沉淀2次,用300 μ L LB液体培养基重悬菌体沉淀, 得到受体菌悬浮液;
[0135] (3)将30 μ L步骤(1)的供体菌悬浮液和300 μ L步骤(2)的受体菌悬浮液混匀后 涂布于LB平板上,30°C培养20-24小时;
[0136] (4)将步骤(3) LB平板上长出的菌用冰上预冷的ImL Sistrom培养基洗脱至EP管 中。4°C 5000rpm下离心2分钟,弃上清液,用500 μ 1冰上预冷的Sistrom培养基洗绦沉淀 两次,最后用100 μ L冰上预冷的Sistrom培养基重悬沉淀,得到菌体悬浮液;
[0137] (5)将步骤(4)的菌体悬浮液涂布在Sistrom平板(Sistrom平板为向Sistrom培 养基中加入K 2TeO3和卡那霉素得到的K2TeO3浓度为150mg/L、卡那霉素浓度为50mg/L的固 体培养基)上,30°C下培养3-5天长出接合子,即为含有pBBRlMCS-2-Tsl的重组类球红细 菌,将该重组菌命名为R. s (pBBRlMCS-2)。
[0138] 按照上述步骤(1) - (5)的方法,分别将重组大肠杆菌S17-1 (pBBRlMCS-2)替 换为 S17-1 (pBBRlMCS-2-Tsl)、S17-1 (pBBRlMCS-2-Ts2)、S17-1 (pBBRlMCS-2-Ts3) 和S17-l(pBBRlMCS-2-Ts4),替他步骤均不变,得到分别含有pBBRlMCS-2-Tsl、 pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 的重组类球红细菌,将这些重组 菌分别命名为 R. s (pBBRlMCS-2-Tsl)、R. s (pBBRlMCS-2-Ts2)、R. s (pBBRlMCS-2-Ts3)和 R.s (pBBRlMCS-2-Ts4)。
[0139] 2、pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在类球 红细菌Rhodobacter sphaeroides 2.4. 1中的温度敏感性
[0140] 将步骤1的R. s (pBBRlMCS-2-Tsl)接种至LB+kan液体培养基中,于30°C培养20 小时,将得到的菌液进行以下处理:
[0141] ①将菌液按I :500的比例接种至3mL LB液体培养基中,然后于30°C下培养24小 时,得到LB-30°C菌液;将LB-30°C菌液稀释后得到LB-30°C稀释菌液,将LB-30°C稀释菌 液分别涂布至LB平板和LB+kan平板上,每个平板100 μ L LB-30°C稀释菌液,然后于30°C 下培养4天,分别得到LB-LB-30°C平板和LB-LB+kan-30°C平板,统计LB-LB-30°C平板和 LB-LB+kan-30°C平板上的菌落数,计算得到重组载体pBBRlMCS-2-Tsl在30°C LB液体培养 基中的丢失率,载体的丢失率=(LB-LB-30°C平板上的菌落数一 LB-LB+kan-30°C平板上的 菌落数)+LB-LB-30°C平板上的菌落数;
[0142] ②将菌液按I :500的比例接种至3mL LB+kan液体培养基中,然后于30°C下 培养24小时,得到LB+kan-30 °C菌液;将LB+kan-30 °C菌液稀释后得到LB+kan-30 °C 稀释菌液,将LB+kan-30 °C稀释菌液分别涂布至LB平板和LB+kan平板上,每个平板 100 μ L LB+kan-30 °C稀释菌液,然后于30 °C下培养4天,分别得到LB+kan-LB-30 °C平板 和 LB+kan_LB+kan_30 °C 平板,统计 LB+kan_LB_30 °C 平板和 LB+kan_LB+kan_30 °C 平板上 的菌落数,计算得到重组载体pBBRlMCS-2-Tsl在30°C LB+kan液体培养基中的丢失率, 载体的丢失率=(LB+kan-LB-30°C平板上的菌落数一 LB+kan-LB+kan-30°C平板上的菌落 数)+ LB+kan-LB-30°C平板上的菌落数;
[0143] ③将菌液按I :500的比例接种至3mL LB液体培养基中,然后于37°C下培养24小 时,得到LB-37°C菌液;将LB-37°C菌液稀释后得到LB-37°C稀释菌液,将LB-37°C稀释菌 液分别涂布至LB平板和LB+kan平板上,每个平板100 μ L LB-37°C稀释菌液,然后于37°C 下培养4天,分别得到LB-LB-37°C平板和LB-LB+kan-37°C平板,统计LB-LB-37°C平板和 LB-LB+kan-37°C平板上的菌落数,计算得到重组载体pBBRlMCS-2-Tsl在37°C LB液体培养 基中的丢失率(表6),载体的丢失率=(LB-LB-37°C平板上的菌落数一 LB-LB+kan-37°C平 板上的菌落数)+LB-LB-37°C平板上的菌落数。
[0144] 按照上述方法,将 R. s(pBBRlMCS-2-Tsl)替换为 R. s(pBBRlMCS-2-Ts2)、 R. s(pBBRlMCS-2-Ts3)、R. s(pBBRlMCS-2-Ts4)和 R. s(pBBRlMCS-2),其他步骤均不变,分 别得到宿主菌为类球红细菌Rhodobacter sphaeroides 2.4. 1时重组载体pBBRlMCS-2、 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 分别在 30°C LB 液 体培养基、30 °C LB+kan液体培养基和37 °C LB液体培养基中的丢失率(表6)。
[0145] 表6、温度敏感型载体在类球红细菌Rhodobacter sphaeroides 2. 4. 1中的丢失 率
[0146]
[0147]
[0148]在宿主菌为类球红细菌 Rhodobacter sphaeroides 2· 4· 1 时,pBBRlMCS-2、 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在 30 °C LB 液 体培养基和30 °C LB+kan液体培养基中的丢失率以及pBBRlMCS-2在37 °C LB液体培养 基中的丢失率均在 13% 以下,pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4在37°C LB液体培养基中的丢失率分别达到78. 18%、81. 36%、80. 53%和 78. 57%,说明 pBBRlMCS-2-Tsl、pBBRlMCS-2-Ts2、pBBRlMCS-2-Ts3 和 pBBRlMCS-2-Ts4 在类 球红细菌Rhodobacter sphaeroides 2. 4. 1中均可表现出其一定的温度敏感性。
【主权项】
1. 构建重组载体的方法,是将SEQIDNo. 1的第1557-2526位所示的DNA片段替换为 目的基因表达盒,并保持SEQIDNo. 1的其他核苷酸不变,得到的重组DNA即为所述重组载 体; 所述目的基因表达盒编码的蛋白质为将SEQIDNo. 2所示的蛋白质进行A3)的改造、 保持SEQIDNo. 2的其它氨基酸残基均不变得到的蛋白质:所述所述A3)为将SEQIDNo. 2 第86位的Arg突变为Cys。2. 根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述目的基因表达盒中的目的基因为将 SEQIDNo. 1的第1794-2456位核苷酸所示的DNA分子进行B3)的改造、保持SEQIDNo. 1 的第1794-2456位核苷酸所示的DNA分子中的其它核苷酸均不变得到的DNA分子;所述B3) 为将SEQIDNo. 1第2049位的C突变为T。3. 根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述目的基因表达盒中启动所述目 的基因表达的启动子为将SEQIDNo. 1的第1557-1793位所示的DNA分子进行如下C2)、 C3)和C4)这三种中至少一种的改造、保持SEQIDNo. 1的第1557-1793位核苷酸所示的 DNA分子中的其它核苷酸均不变得到的DNA分子: C2)如下C21)和 / 或C22): C21)将SEQIDNo. 1第1732位的A突变为G; C22)将SEQIDNo. 1第1780位的G突变为T; C3)如下C31)和 / 或C32): C31)将SEQIDNo. 1第1747位的C突变为T; C32)将SEQIDNo. 1第1776位的T突变为A; C4)将SEQIDNo. 1第1751位的T突变为A; 所述目的基因表达盒中终止所述目的基因表达的终止子为SEQIDNo. 1的第 2457-2526位所示的DNA分子。4. 构建重组载体的方法,是将SEQIDNo. 1的第1557-2526位所示的DNA片段替换为 目的基因表达盒,并保持SEQIDNo. 1的其他核苷酸不变,得到的重组DNA即为所述重组载 体; 所述目的基因表达盒编码的蛋白质为将SEQIDNo. 2所示的蛋白质进行权利要求1所 述A3)和下述A4)的改造、保持SEQIDNo. 2的其它氨基酸残基均不变得到的蛋白质: A4)如下A41)和 / 或A42): A41)将SEQIDNo. 2 第 25 位的Lys突变为Glu; A42)将SEQIDNo. 2 第 146 位的Ile突变为Val。5. 根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述目的基因表达盒中的目的基因为将 SEQIDNo. 1的第1794-2456位核苷酸所示的DNA分子进行权利要求2所述B3)和下述B4) 的改造、保持SEQIDNo. 1的第1794-2456位核苷酸所示的DNA分子中的其它核苷酸均不 变得到的DNA分子: B4)为如下B41)和/或M2): B41)将SEQIDNo. 1第1866位的A突变为G; B42)将SEQIDNo. 1第2229位的A突变为G。6. 根据权利要求4或5所述的方法,其特征在于:所述目的基因表达盒中启动所述目 的基因表达的启动子为权利要求3所述启动子; 所述目的基因表达盒中终止所述目的基因表达的终止子为权利要求3所述终止子。7. 由权利要求1-6中任一所述方法构建的重组载体。8. 含有权利要求7所述重组载体的重组微生物或重组细胞系。9. 下述任一产品: Pl、权利要求1或4所述蛋白质; P2、权利要求2或5所述目的基因; P3、DNA分子,为将SEQIDNo. 1的第1557-1793位所示的DNA分子进行权利要求3所 述C3)或下述Z34)的改造、保持SEQIDNo. 1的第1557-1793位核苷酸所示的DNA分子中 的其它核苷酸均不变得到的DNA分子; Z34)为权利要求3所述C3)和所述C4)。10. 下述任一应用: L1、权利要求2或5所述目的基因或权利要求9所述DNA分子在制备温度敏感载体中 的应用; L2、权利要求9所述DNA分子在作为启动子中的应用; L3、权利要求7所述重组载体在作为温度敏感载体中的应用。
【专利摘要】本发明公开了温度敏感型载体pBBR1MCS-2-Ts3及其应用。本发明所提供的温度敏感型载体pBBR1MCS-2-Ts3,构建重组载体的方法,是将SEQ ID No.1的第1557-2526位所示的DNA片段替换为目的基因表达盒,并保持SEQ ID No.1的其他核苷酸不变,得到的重组载体;目的基因表达盒编码的蛋白质为将SEQ ID No.2所示的蛋白质进行A3)的改造、保持SEQ ID No.2的其它氨基酸残基均不变得到的蛋白质:所述A3)为将SEQ ID No.2第86位的Arg突变为Cys。
【IPC分类】C12N15/66, C12N15/63
【公开号】CN104894155
【申请号】CN201510340762
【发明人】黄建忠, 江贤章, 周芬, 刘洪娇, 祁峰, 张明亮, 陶勇
【申请人】福建师范大学
【公开日】2015年9月9日
【申请日】2015年6月18日