一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体str基因座分型结果的方法和系统的制作方法
一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体str基因座分型结果的方法和系统的制作方法
【专利摘要】本发明提供一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果的方法和系统，所述方法包括：获得差异Y-STR基因座；获得足够量的Y型精子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果，将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体的常染色体STR分型结果。本发明还提供了一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果的系统。本发明的方案通过综合分析常染色体STR和Y-STR分型结果能有效获得混合精斑中单个个体的分型结果，进而为公安机关迅速确定犯罪嫌疑人提供有力的技术支撑。
【专利说明】一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分 型结果的方法和系统
【技术领域】
[0001] 本发明涉及一种推断分型方法和系统，尤其涉及一种从混合精斑中获得单个个体 的常染色体STR基因座分型结果的方法和系统。
【背景技术】
[0002] 从性侵案件现场中提取的生物证据往往是男性和女性体液的混合物，有些情况下 则是不同男性体液的混合物（如，混合精斑）。而后者往往是刑事案件侦察和侦破的关键， 目前主要是通过对混合精斑中不同男性供者的DNA的分析，实现排除和确定犯罪嫌疑人。
[0003] 而现在针对混合精斑的检验程序，比如差异裂解法，只能把女性样本去除掉，并不 能分离不同男性供者的精子DNA，检验得到的是不同来源人的混合图谱，而混合图谱往往只 能用于排除而不能进行认定个体。后续需要对图谱使用计算机软件进行人工拆分，其结果 依赖于不同的计算模型和统计方法，往往不同的实验者操作会获得不同的结果，对于有些 刑事案件中多于两人，如三人及以上的混合样品，这样的拆分就会更加困难，通常不能有效 的对不同男性供者的DNA进行区分。
[0004] 现有的研究证实联合使用激光捕获显微切割（LCM)和LV - PCR方法可获得单个精 子的常染色体STR分型，但由于精子细胞通过减数分裂形成，只含有一半的遗传物质，对混 合精斑中精子细胞DNA进行常染色体STR分型，只能获得大量不同的常染色体STR单倍型 分型结果，很难区分该单倍型分型结果是针对哪个男性的，因此无法进行同一认定和个体 识别。Y-STR分型是常用的通过Y染色体基因座分型来确定父系亲缘关系，排除嫌疑人的分 型方法，然而同一父系遗传的家族男性个体的精子Y-STR基因座分型是一样的，因此仅靠 Y-STR基因座分型难以进行同一认定和个体识别。
[0005] 如何通过结合常染色体STR和Y-STR分型结果，有效获得混合精斑中单个个体的 分型结果，进而为公安机关迅速确定犯罪嫌疑人提供有力的技术支撑成为有待解决的问 题。
【发明内容】
[0006] 本发明提供了一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果 的方法，通过获得差异Y-STR基因座，将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细 胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体的常染色 体STR分型结果，根据该结果可以从混合精斑DNA中获得单个个体的分型结果，进而为公安 机关迅速确定犯罪嫌疑人提供有力的技术支撑。
[0007] 本发明还提供了一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结 果的系统，通过该体系通过结合常染色体STR和Y-STR分型结果，实现从混合精斑中DNA中 获得单个个体常染色体STR基因座的分型结果。
[0008] 本发明提供了一种推断混合精斑中DNA个体来源的方法，通过获得差异Y-STR基 因座，将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座单倍 型分型结果进行合并，得到混合精斑中所含有的各个体的常染色体STR分型结果，根据该 结果进行混合精斑中DNA个体来源的有效推断，为公安机关迅速确定犯罪嫌疑人提供有力 的技术支撑。
[0009] 本发明还提供了一种推断混合精斑中DNA个体来源的系统，通过该体系通过结合 常染色体STR和Y-STR分型结果，实现对混合精斑中DNA个体来源推断。
[0010] 本发明提供的一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果 的方法，所述混合精斑为来自两个以上个体的混合精斑，该方法包括：
[0011] 1)获得混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分型结果，从该分型结果确定出各个 体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异Y-STR基因座；
[0012] 2)从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精子细胞的所 述差异Y-STR基因座、常染色体STR基因座、以及性别决定基因座Amelogenin的分型结果；
[0013] 其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所述足 够量的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y型精 子细胞；
[0014] 3)分别将所述差异γ-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基 因座单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体的常染色体STR分型结果。
[0015] 在本发明的方案中，所述混合精斑是来自于两个以上无父系血缘关系的个体的混 合精斑。
[0016] 进一步的，所述个体为来自中国人群的个体，所述Y-STR基因座为DYS456， DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS635, DYS392,Y GATA H4,DYS437, DYS438 和 DYS448。
[0017] 进一步的，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的STR基因座，例如STR 基因座 D5S818, D21S11，D7S820, D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391的组合。这些基因座是 申请人:通过对中国人群的生活环境、种族起源等进行综合分 析，考察各地区民族人口的表型特征差异，包括外形特征，生理指标等，针对这些差异进行 文献和网络数据库调研，在已有研究的基础上获得的特异性的基因座的组合。
[0018] 在本发明的一个【具体实施方式】中，获得所述基因座分型结果的过程包括采用与所 述基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得所述基 因座的基因型的步骤，其中，混合精斑中DNA的γ-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列；所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多条核苷酸序列；所述常染色体STR基因座，以及性别决定 基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
[0019] 在本发明的方案中，获得混合精斑DNA的γ-STR基因座的混合分型结果可以采用 本领域常规手段，例如采用差异裂解法获得。进一步的，从所述混合精斑中分离足够量的Y 型精子细胞可以采用本领域常规的从精液中分离精子单细胞的方法，例如激光捕获显微切 割法、显微吸针吸取法或流式细胞仪分离等。更进一步的，分别将所述差异Y-STR基因座分 型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并指的是首先将 差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞归为一组，然后将归为一组的Y型精子细 胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果综合为常染色体STR基因座分型结果，该常染色 体STR基因座分型结果即为混合精斑中单个个体的常染色体STR分型结果。
[0020] 进一步的，在本发明的方案中，所采用的Y-STR基因座为经 申请人:大量实验验证 的在中国人群的不同男性个体之间具有高度特异性的Y-STR基因座，从这些Y-STR基因座 的分型结果中，可以确定出各个体之间分型结果均有差异的所述差异Y-STR基因座。并且 基于本申请中给出的针对这些Y-STR基因座的引物序列，针对不同的男性个体本领域技术 人员可以通过常规手段获得所述差异Y-STR基因座，当然本领域技术人员也可以根据实际 情况使用在上述引物基础上进行改进或微调而获得的引物序列来对所述Y-STR基因座进 行扩增和分型，从而获得所述差异Y-STR基因座。
[0021] 更进一步的，所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多条核苷酸序列，是指在本申请方案中，根据混合精斑中男性个体的不同， 会获得一个或多个差异Y-STR基因座，根据获得的具体的差异Y-STR基因座，本领域技术人 员可以从本申请给出的针对Y-STR基因座的引物序列中挑选针对该差异Y-STR基因座的引 物序列来实施本申请的方案，当然也可以根据其他本领域存在的手段设计针对这些基因座 的引物，只要能实现相应基因座的扩增即可。在实施本申请的方案的过程中，可以只使用一 个差异Y-STR基因座，也可以使用1-5个差异Y-STR基因座，本领域技术人员可以根据需要 进行选择。
[0022] 本发明还提供了一种从混合DNA中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果 的方法，所述混合DNA来自两个以上男性个体的混合体细胞，该方法包括 ：
[0023] 1)获得混合DNA的Y-STR基因座的混合分型结果，从该分型结果确定出各个体之 间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异Y-STR基因座；
[0024] 2)从所述混合体细胞中分离足够量的体细胞，分别获得各体细胞的所述差异 Y-STR基因座、常染色体STR基因座、以及性别决定基因座Amelogenin的分型结果；
[0025] 所述足够量的体细胞指分离的细胞中包含了各个体的至少10个体细胞；
[0026] 3)分别将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的体细胞的常染色体STR基因座单 倍型分型结果进行组合，即得到混合精斑中单个个体的常染色体STR分型结果。
[0027] 本发明提供的一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果 的系统，包括获得差异Y-STR基因座体系，分型体系、常染色体STR分型体系；
[0028] 所述获得差异Y-STR基因座体系用于获得混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分 型结果，从该分型结果确定出各个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即 差异Y-STR基因座；
[0029] 所述分型体系用于从所述混合精斑中分离足够量的单个Y型精子细胞，分别获 得各Y型精子细胞的所述差异Y-STR基因座、常染色体STR基因座、以及性别决定基因座 Amelogenin的分型结果，其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分 型结果，所述足够量的单个Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体 的至少10个Y型精子细胞；
[0030] 所述常染色体STR分型体系用于分别将所述差异γ-STR基因座分型结果相同的Y 型精子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体 的常染色体STR分型结果。
[0031] 进一步的，在所述从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果的 系统中，所述个体为来自中国人群的个体，所述Y-STR基因座为DYS456, DYS390, DYS458, D YS19，DYS385a/b，DYS393，DYS391，DYS439，DYS635，DYS392，Y GATA H4，DYS437，DYS438 和 DYS448。
[0032] 进一步的，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的STR基因座，例如STR 基因座 D5S818, D21S11，D7S820, D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391的组合。
[0033] 本发明提供的一种推断混合精斑中DNA个体来源的方法，所述混合精斑为来自两 个以上个体的混合精斑，该方法包括：
[0034] 1)获得上述混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分型结果，从该分型结果中确定 出各个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异Y-STR基因座；
[0035] 2)从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精子细胞的所 述差异Y-STR基因座、常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin的分型结果；
[0036] 其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所述足 够量的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y型精 子细胞，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的常染色体STR基因座的组合；
[0037] 3)分别将差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座 单倍型分型结果进行合并，得到混合精斑中单个个体的常染色体STR基因座分型结果；
[0038] 4)根据上述单个个体的常染色体STR基因座的分型结果推断混合精斑中DNA的个 体来源。
[0039] 进一步的，所述个体为来自中国人群的个体，所述Y-STR基因座为DYS456， DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS635, DYS392,Y GATA H4, DYS437, DYS438 和 DYS448 ;所述常染色体 STR 基因座为 D5S818, D21S11，D7S820， D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391。
[0040] 进一步的，在本发明的方案中，获得所述基因座分型结果的过程包括采用与所述 基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得所述基因 座的基因型的步骤，其中，混合精斑中DNA的γ-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列；所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多条核苷酸序列；所述常染色体STR基因座，以及性别决定 基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
[0041] 在本发明的另一个【具体实施方式】中，可以通过遗传分析仪分析所述扩增产物获得 所述基因座的基因型。进一步的，所述遗传分析仪可以是本领域技术人员常规使用的遗传 分析仪，例如ABI3130或ABI3500型遗传分析仪。通过GeneMapper? ID-X软件或其他 GeneMapper软件等分析该PCR扩增产物中所述基因座的基因型。
[0042] 更进一步的，所述PCR扩增引物可以为具有荧光的PCR扩增引物（如表2和4所 示）。在本发明的实施方式中，通过所述遗传分析仪，将实际扩增出的产物长度、产物颜色与 表2和4中记载的引物要扩增的长度、产物颜色进行比对，实际扩增出的产物长度只要与表 2和4记载的扩增长度相等或相近即可，二者可以存在偏差，只要在本领域技术人员可以接 受的范围内即可，或者通过测序确认是所要扩增的片段即可。
[0043] 本发明提供的一种推断混合精斑中DNA个体来源的系统，包括获得差异Y-STR基 因座体系，分型体系、常染色体STR分型体系和推断体系，
[0044] 所述获得差异Y-STR基因座体系用于获得上述混合精斑中DNA的Y-STR基因座的 混合分型结果，从该分型结果中确定出各个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基 因座，即差异Y-STR基因座；
[0045] 所述分型体系用于从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得 各Y型精子细胞的所述差异γ-STR基因座、常染色体STR基因座，以及性别决定基因座 Amelogenin的分型结果，其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分 型结果，所述足够量的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至 少10个Y型精子细胞，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的常染色体STR基因座 的组合；
[0046] 所述常染色体STR分型体系用于分别将差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精 子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，得到混合精斑中单个个体的常染 色体STR基因座分型结果；
[0047] 所述推断体系用于根据上述单个个体的常染色体STR基因座的分型结果推断混 合精斑中DNA的个体来源。
[0048] 进一步的，在本发明的系统中，所述个体为来自中国人群的个体，所述Y-STR基因 座为 DYS456, DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS635, DYS392, Y GATA H4,DYS437,DYS438 和 DYS448 ;所述常染色体 STR 基因座为 D5S818, D21S11，D7S820， D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391。
[0049] 更进一步的，在本发明的系统中，获得所述基因座分型结果的过程包括采用与所 述基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得所述基 因座的基因型的步骤，其中，混合精斑中DNA的Y-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列；所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多条核苷酸序列；所述常染色体STR基因座，以及性别决定 基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
[0050] 在本发明的方案中，所述14个Y-STR基因座的信息如下表1所示：
[0051] 表 1
[0052]
【权利要求】
1. 一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果的方法，所述混合 精斑为来自两个以上个体的混合精斑，其特征在于，该方法包括 ： 1) 获得混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分型结果，从该分型结果确定出各个体之 间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异Y-STR基因座； 2) 从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精子细胞的所述差 异Y-STR基因座、常染色体STR基因座、以及性别决定基因座Amelogenin的分型结果； 其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所述足够量 的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y型精子细 胞； 3) 分别将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座 单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体的常染色体STR分型结果。
2. 根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述个体为来自中国人群的个体，所述 Y-STR 基因座为 DYS456, DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS63 5, DYS392, Y GATA H4, DYS437, DYS438和DYS448 ;所述常染色体STR基因座为能进行个体 识别的 STR 基因座 D5S818, D21S11，D7S820, D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391 的组合。
3. 根据权利要求2所述的方法，其特征在于，获得所述基因座分型结果的过程包括采 用与所述基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得 所述基因座的基因型的步骤， 其中，混合精斑中DNA的Y-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列； 所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多 条核苷酸序列； 所述常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中 SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
4. 一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果的系统，其特征在 于，所述系统包括获得差异Y-STR基因座体系，分型体系、常染色体STR分型体系； 所述获得差异Y-STR基因座体系用于获得混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分型结 果，从该分型结果确定出各个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异 Y-STR基因座； 所述分型体系用于从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精 子细胞的所述差异Y-STR基因座、常染色体STR基因座、以及性别决定基因座Amelogenin 的分型结果，其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所 述足够量的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y 型精子细胞； 所述常染色体STR分型体系用于分别将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精 子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体的常 染色体STR分型结果。
5. -种推断混合精斑中DNA个体来源的方法，所述混合精斑为来自两个以上个体的混 合精斑，其特征在于，该方法包括： 1) 获得上述混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分型结果，从该分型结果中确定出各 个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异Y-STR基因座； 2) 从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精子细胞的所述差 异Y-STR基因座、常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin的分型结果； 其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所述足够量 的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y型精子细 胞，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的常染色体STR基因座的组合； 3) 分别将差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座单倍 型分型结果进行合并，得到混合精斑中单个个体的常染色体STR基因座分型结果； 4) 根据上述单个个体的常染色体STR基因座的分型结果推断混合精斑中DNA的个体来 源。
6. 根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述个体为来自中国人群的个体，所述 Y-STR 基因座为 DYS456, DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS 635, DYS392, Y GATA H4, DYS437, DYS438 和 DYS448 ;所述常染色体 STR 基因座为 D5S818， D21S11，D7S820, D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391。
7. 根据权利要求6所述的方法，其特征在于，获得所述基因座分型结果的过程包括采 用与所述基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得 所述基因座的基因型的步骤， 其中，混合精斑中DNA的Y-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列； 所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多 条核苷酸序列； 所述常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中 SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
8. -种推断混合精斑中DNA个体来源的系统，其特征在于，包括获得差异Y-STR基因座 体系，分型体系、常染色体STR分型体系和推断体系， 所述获得差异Y-STR基因座体系用于获得上述混合精斑中DNA的Y-STR基因座的混 合分型结果，从该分型结果中确定出各个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因 座，即差异Y-STR基因座； 所述分型体系用于从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精 子细胞的所述差异Y-STR基因座、常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin 的分型结果，其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所 述足够量的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y 型精子细胞，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的常染色体STR基因座的组合； 所述常染色体STR分型体系用于分别将差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细 胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，得到混合精斑中单个个体的常染色体 STR基因座分型结果； 所述推断体系用于根据上述单个个体的常染色体STR基因座的分型结果推断混合精 斑中DNA的个体来源。
9. 根据权利要求8所述的系统，其特征在于，所述个体为来自中国人群的个体，所述 Y-STR 基因座为 DYS456, DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS 635, DYS392, Y GATA H4, DYS437, DYS438 和 DYS448 ;所述常染色体 STR 基因座为 D5S818， D21S11，D7S820, D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391。
10. 根据权利要求9所述的系统，其特征在于，获得所述基因座分型结果的过程包括采 用与所述基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得 所述基因座的基因型的步骤， 其中，混合精斑中DNA的Y-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列； 所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多 条核苷酸序列； 所述常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中 SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
【文档编号】C12Q1/68GK104232751SQ201410251298
【公开日】2014年12月24日 申请日期:2014年6月6日 优先权日:2014年6月6日
【发明者】李彩霞, 丰蕾, 涂政 申请人:公安部物证鉴定中心
【专利摘要】本发明提供一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果的方法和系统，所述方法包括：获得差异Y-STR基因座；获得足够量的Y型精子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果，将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体的常染色体STR分型结果。本发明还提供了一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果的系统。本发明的方案通过综合分析常染色体STR和Y-STR分型结果能有效获得混合精斑中单个个体的分型结果，进而为公安机关迅速确定犯罪嫌疑人提供有力的技术支撑。
【专利说明】一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分 型结果的方法和系统
【技术领域】
[0001] 本发明涉及一种推断分型方法和系统，尤其涉及一种从混合精斑中获得单个个体 的常染色体STR基因座分型结果的方法和系统。
【背景技术】
[0002] 从性侵案件现场中提取的生物证据往往是男性和女性体液的混合物，有些情况下 则是不同男性体液的混合物（如，混合精斑）。而后者往往是刑事案件侦察和侦破的关键， 目前主要是通过对混合精斑中不同男性供者的DNA的分析，实现排除和确定犯罪嫌疑人。
[0003] 而现在针对混合精斑的检验程序，比如差异裂解法，只能把女性样本去除掉，并不 能分离不同男性供者的精子DNA，检验得到的是不同来源人的混合图谱，而混合图谱往往只 能用于排除而不能进行认定个体。后续需要对图谱使用计算机软件进行人工拆分，其结果 依赖于不同的计算模型和统计方法，往往不同的实验者操作会获得不同的结果，对于有些 刑事案件中多于两人，如三人及以上的混合样品，这样的拆分就会更加困难，通常不能有效 的对不同男性供者的DNA进行区分。
[0004] 现有的研究证实联合使用激光捕获显微切割（LCM)和LV - PCR方法可获得单个精 子的常染色体STR分型，但由于精子细胞通过减数分裂形成，只含有一半的遗传物质，对混 合精斑中精子细胞DNA进行常染色体STR分型，只能获得大量不同的常染色体STR单倍型 分型结果，很难区分该单倍型分型结果是针对哪个男性的，因此无法进行同一认定和个体 识别。Y-STR分型是常用的通过Y染色体基因座分型来确定父系亲缘关系，排除嫌疑人的分 型方法，然而同一父系遗传的家族男性个体的精子Y-STR基因座分型是一样的，因此仅靠 Y-STR基因座分型难以进行同一认定和个体识别。
[0005] 如何通过结合常染色体STR和Y-STR分型结果，有效获得混合精斑中单个个体的 分型结果，进而为公安机关迅速确定犯罪嫌疑人提供有力的技术支撑成为有待解决的问 题。
【发明内容】
[0006] 本发明提供了一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果 的方法，通过获得差异Y-STR基因座，将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细 胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体的常染色 体STR分型结果，根据该结果可以从混合精斑DNA中获得单个个体的分型结果，进而为公安 机关迅速确定犯罪嫌疑人提供有力的技术支撑。
[0007] 本发明还提供了一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结 果的系统，通过该体系通过结合常染色体STR和Y-STR分型结果，实现从混合精斑中DNA中 获得单个个体常染色体STR基因座的分型结果。
[0008] 本发明提供了一种推断混合精斑中DNA个体来源的方法，通过获得差异Y-STR基 因座，将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座单倍 型分型结果进行合并，得到混合精斑中所含有的各个体的常染色体STR分型结果，根据该 结果进行混合精斑中DNA个体来源的有效推断，为公安机关迅速确定犯罪嫌疑人提供有力 的技术支撑。
[0009] 本发明还提供了一种推断混合精斑中DNA个体来源的系统，通过该体系通过结合 常染色体STR和Y-STR分型结果，实现对混合精斑中DNA个体来源推断。
[0010] 本发明提供的一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果 的方法，所述混合精斑为来自两个以上个体的混合精斑，该方法包括：
[0011] 1)获得混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分型结果，从该分型结果确定出各个 体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异Y-STR基因座；
[0012] 2)从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精子细胞的所 述差异Y-STR基因座、常染色体STR基因座、以及性别决定基因座Amelogenin的分型结果；
[0013] 其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所述足 够量的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y型精 子细胞；
[0014] 3)分别将所述差异γ-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基 因座单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体的常染色体STR分型结果。
[0015] 在本发明的方案中，所述混合精斑是来自于两个以上无父系血缘关系的个体的混 合精斑。
[0016] 进一步的，所述个体为来自中国人群的个体，所述Y-STR基因座为DYS456， DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS635, DYS392,Y GATA H4,DYS437, DYS438 和 DYS448。
[0017] 进一步的，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的STR基因座，例如STR 基因座 D5S818, D21S11，D7S820, D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391的组合。这些基因座是 申请人:通过对中国人群的生活环境、种族起源等进行综合分 析，考察各地区民族人口的表型特征差异，包括外形特征，生理指标等，针对这些差异进行 文献和网络数据库调研，在已有研究的基础上获得的特异性的基因座的组合。
[0018] 在本发明的一个【具体实施方式】中，获得所述基因座分型结果的过程包括采用与所 述基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得所述基 因座的基因型的步骤，其中，混合精斑中DNA的γ-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列；所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多条核苷酸序列；所述常染色体STR基因座，以及性别决定 基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
[0019] 在本发明的方案中，获得混合精斑DNA的γ-STR基因座的混合分型结果可以采用 本领域常规手段，例如采用差异裂解法获得。进一步的，从所述混合精斑中分离足够量的Y 型精子细胞可以采用本领域常规的从精液中分离精子单细胞的方法，例如激光捕获显微切 割法、显微吸针吸取法或流式细胞仪分离等。更进一步的，分别将所述差异Y-STR基因座分 型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并指的是首先将 差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞归为一组，然后将归为一组的Y型精子细 胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果综合为常染色体STR基因座分型结果，该常染色 体STR基因座分型结果即为混合精斑中单个个体的常染色体STR分型结果。
[0020] 进一步的，在本发明的方案中，所采用的Y-STR基因座为经 申请人:大量实验验证 的在中国人群的不同男性个体之间具有高度特异性的Y-STR基因座，从这些Y-STR基因座 的分型结果中，可以确定出各个体之间分型结果均有差异的所述差异Y-STR基因座。并且 基于本申请中给出的针对这些Y-STR基因座的引物序列，针对不同的男性个体本领域技术 人员可以通过常规手段获得所述差异Y-STR基因座，当然本领域技术人员也可以根据实际 情况使用在上述引物基础上进行改进或微调而获得的引物序列来对所述Y-STR基因座进 行扩增和分型，从而获得所述差异Y-STR基因座。
[0021] 更进一步的，所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多条核苷酸序列，是指在本申请方案中，根据混合精斑中男性个体的不同， 会获得一个或多个差异Y-STR基因座，根据获得的具体的差异Y-STR基因座，本领域技术人 员可以从本申请给出的针对Y-STR基因座的引物序列中挑选针对该差异Y-STR基因座的引 物序列来实施本申请的方案，当然也可以根据其他本领域存在的手段设计针对这些基因座 的引物，只要能实现相应基因座的扩增即可。在实施本申请的方案的过程中，可以只使用一 个差异Y-STR基因座，也可以使用1-5个差异Y-STR基因座，本领域技术人员可以根据需要 进行选择。
[0022] 本发明还提供了一种从混合DNA中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果 的方法，所述混合DNA来自两个以上男性个体的混合体细胞，该方法包括 ：
[0023] 1)获得混合DNA的Y-STR基因座的混合分型结果，从该分型结果确定出各个体之 间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异Y-STR基因座；
[0024] 2)从所述混合体细胞中分离足够量的体细胞，分别获得各体细胞的所述差异 Y-STR基因座、常染色体STR基因座、以及性别决定基因座Amelogenin的分型结果；
[0025] 所述足够量的体细胞指分离的细胞中包含了各个体的至少10个体细胞；
[0026] 3)分别将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的体细胞的常染色体STR基因座单 倍型分型结果进行组合，即得到混合精斑中单个个体的常染色体STR分型结果。
[0027] 本发明提供的一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果 的系统，包括获得差异Y-STR基因座体系，分型体系、常染色体STR分型体系；
[0028] 所述获得差异Y-STR基因座体系用于获得混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分 型结果，从该分型结果确定出各个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即 差异Y-STR基因座；
[0029] 所述分型体系用于从所述混合精斑中分离足够量的单个Y型精子细胞，分别获 得各Y型精子细胞的所述差异Y-STR基因座、常染色体STR基因座、以及性别决定基因座 Amelogenin的分型结果，其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分 型结果，所述足够量的单个Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体 的至少10个Y型精子细胞；
[0030] 所述常染色体STR分型体系用于分别将所述差异γ-STR基因座分型结果相同的Y 型精子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体 的常染色体STR分型结果。
[0031] 进一步的，在所述从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果的 系统中，所述个体为来自中国人群的个体，所述Y-STR基因座为DYS456, DYS390, DYS458, D YS19，DYS385a/b，DYS393，DYS391，DYS439，DYS635，DYS392，Y GATA H4，DYS437，DYS438 和 DYS448。
[0032] 进一步的，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的STR基因座，例如STR 基因座 D5S818, D21S11，D7S820, D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391的组合。
[0033] 本发明提供的一种推断混合精斑中DNA个体来源的方法，所述混合精斑为来自两 个以上个体的混合精斑，该方法包括：
[0034] 1)获得上述混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分型结果，从该分型结果中确定 出各个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异Y-STR基因座；
[0035] 2)从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精子细胞的所 述差异Y-STR基因座、常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin的分型结果；
[0036] 其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所述足 够量的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y型精 子细胞，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的常染色体STR基因座的组合；
[0037] 3)分别将差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座 单倍型分型结果进行合并，得到混合精斑中单个个体的常染色体STR基因座分型结果；
[0038] 4)根据上述单个个体的常染色体STR基因座的分型结果推断混合精斑中DNA的个 体来源。
[0039] 进一步的，所述个体为来自中国人群的个体，所述Y-STR基因座为DYS456， DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS635, DYS392,Y GATA H4, DYS437, DYS438 和 DYS448 ;所述常染色体 STR 基因座为 D5S818, D21S11，D7S820， D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391。
[0040] 进一步的，在本发明的方案中，获得所述基因座分型结果的过程包括采用与所述 基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得所述基因 座的基因型的步骤，其中，混合精斑中DNA的γ-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列；所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多条核苷酸序列；所述常染色体STR基因座，以及性别决定 基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
[0041] 在本发明的另一个【具体实施方式】中，可以通过遗传分析仪分析所述扩增产物获得 所述基因座的基因型。进一步的，所述遗传分析仪可以是本领域技术人员常规使用的遗传 分析仪，例如ABI3130或ABI3500型遗传分析仪。通过GeneMapper? ID-X软件或其他 GeneMapper软件等分析该PCR扩增产物中所述基因座的基因型。
[0042] 更进一步的，所述PCR扩增引物可以为具有荧光的PCR扩增引物（如表2和4所 示）。在本发明的实施方式中，通过所述遗传分析仪，将实际扩增出的产物长度、产物颜色与 表2和4中记载的引物要扩增的长度、产物颜色进行比对，实际扩增出的产物长度只要与表 2和4记载的扩增长度相等或相近即可，二者可以存在偏差，只要在本领域技术人员可以接 受的范围内即可，或者通过测序确认是所要扩增的片段即可。
[0043] 本发明提供的一种推断混合精斑中DNA个体来源的系统，包括获得差异Y-STR基 因座体系，分型体系、常染色体STR分型体系和推断体系，
[0044] 所述获得差异Y-STR基因座体系用于获得上述混合精斑中DNA的Y-STR基因座的 混合分型结果，从该分型结果中确定出各个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基 因座，即差异Y-STR基因座；
[0045] 所述分型体系用于从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得 各Y型精子细胞的所述差异γ-STR基因座、常染色体STR基因座，以及性别决定基因座 Amelogenin的分型结果，其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分 型结果，所述足够量的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至 少10个Y型精子细胞，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的常染色体STR基因座 的组合；
[0046] 所述常染色体STR分型体系用于分别将差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精 子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，得到混合精斑中单个个体的常染 色体STR基因座分型结果；
[0047] 所述推断体系用于根据上述单个个体的常染色体STR基因座的分型结果推断混 合精斑中DNA的个体来源。
[0048] 进一步的，在本发明的系统中，所述个体为来自中国人群的个体，所述Y-STR基因 座为 DYS456, DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS635, DYS392, Y GATA H4,DYS437,DYS438 和 DYS448 ;所述常染色体 STR 基因座为 D5S818, D21S11，D7S820， D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391。
[0049] 更进一步的，在本发明的系统中，获得所述基因座分型结果的过程包括采用与所 述基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得所述基 因座的基因型的步骤，其中，混合精斑中DNA的Y-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列；所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多条核苷酸序列；所述常染色体STR基因座，以及性别决定 基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
[0050] 在本发明的方案中，所述14个Y-STR基因座的信息如下表1所示：
[0051] 表 1
[0052]
【权利要求】
1. 一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果的方法，所述混合 精斑为来自两个以上个体的混合精斑，其特征在于，该方法包括 ： 1) 获得混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分型结果，从该分型结果确定出各个体之 间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异Y-STR基因座； 2) 从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精子细胞的所述差 异Y-STR基因座、常染色体STR基因座、以及性别决定基因座Amelogenin的分型结果； 其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所述足够量 的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y型精子细 胞； 3) 分别将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座 单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体的常染色体STR分型结果。
2. 根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述个体为来自中国人群的个体，所述 Y-STR 基因座为 DYS456, DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS63 5, DYS392, Y GATA H4, DYS437, DYS438和DYS448 ;所述常染色体STR基因座为能进行个体 识别的 STR 基因座 D5S818, D21S11，D7S820, D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391 的组合。
3. 根据权利要求2所述的方法，其特征在于，获得所述基因座分型结果的过程包括采 用与所述基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得 所述基因座的基因型的步骤， 其中，混合精斑中DNA的Y-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列； 所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多 条核苷酸序列； 所述常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中 SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
4. 一种从混合精斑中获得单个个体的常染色体STR基因座分型结果的系统，其特征在 于，所述系统包括获得差异Y-STR基因座体系，分型体系、常染色体STR分型体系； 所述获得差异Y-STR基因座体系用于获得混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分型结 果，从该分型结果确定出各个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异 Y-STR基因座； 所述分型体系用于从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精 子细胞的所述差异Y-STR基因座、常染色体STR基因座、以及性别决定基因座Amelogenin 的分型结果，其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所 述足够量的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y 型精子细胞； 所述常染色体STR分型体系用于分别将所述差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精 子细胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，即得到混合精斑中单个个体的常 染色体STR分型结果。
5. -种推断混合精斑中DNA个体来源的方法，所述混合精斑为来自两个以上个体的混 合精斑，其特征在于，该方法包括： 1) 获得上述混合精斑DNA的Y-STR基因座的混合分型结果，从该分型结果中确定出各 个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因座，即差异Y-STR基因座； 2) 从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精子细胞的所述差 异Y-STR基因座、常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin的分型结果； 其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所述足够量 的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y型精子细 胞，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的常染色体STR基因座的组合； 3) 分别将差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细胞的常染色体STR基因座单倍 型分型结果进行合并，得到混合精斑中单个个体的常染色体STR基因座分型结果； 4) 根据上述单个个体的常染色体STR基因座的分型结果推断混合精斑中DNA的个体来 源。
6. 根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述个体为来自中国人群的个体，所述 Y-STR 基因座为 DYS456, DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS 635, DYS392, Y GATA H4, DYS437, DYS438 和 DYS448 ;所述常染色体 STR 基因座为 D5S818， D21S11，D7S820, D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391。
7. 根据权利要求6所述的方法，其特征在于，获得所述基因座分型结果的过程包括采 用与所述基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得 所述基因座的基因型的步骤， 其中，混合精斑中DNA的Y-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列； 所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多 条核苷酸序列； 所述常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中 SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
8. -种推断混合精斑中DNA个体来源的系统，其特征在于，包括获得差异Y-STR基因座 体系，分型体系、常染色体STR分型体系和推断体系， 所述获得差异Y-STR基因座体系用于获得上述混合精斑中DNA的Y-STR基因座的混 合分型结果，从该分型结果中确定出各个体之间分型结果均有差异的至少一个Y-STR基因 座，即差异Y-STR基因座； 所述分型体系用于从所述混合精斑中分离足够量的Y型精子细胞，分别获得各Y型精 子细胞的所述差异Y-STR基因座、常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin 的分型结果，其中所述常染色体STR基因座的分型结果为该基因座的单倍型分型结果，所 述足够量的Y型精子细胞指分离的精子细胞中包含了该混合精斑中各个体的至少10个Y 型精子细胞，所述常染色体STR基因座为能进行个体识别的常染色体STR基因座的组合； 所述常染色体STR分型体系用于分别将差异Y-STR基因座分型结果相同的Y型精子细 胞的常染色体STR基因座单倍型分型结果进行合并，得到混合精斑中单个个体的常染色体 STR基因座分型结果； 所述推断体系用于根据上述单个个体的常染色体STR基因座的分型结果推断混合精 斑中DNA的个体来源。
9. 根据权利要求8所述的系统，其特征在于，所述个体为来自中国人群的个体，所述 Y-STR 基因座为 DYS456, DYS390, DYS458, DYS19, DYS385a/b, DYS393, DYS391, DYS439, DYS 635, DYS392, Y GATA H4, DYS437, DYS438 和 DYS448 ;所述常染色体 STR 基因座为 D5S818， D21S11，D7S820, D3S1358, VWA，D8S1179, D16S539, D6S1043, D13S317 和 D12S391。
10. 根据权利要求9所述的系统，其特征在于，获得所述基因座分型结果的过程包括采 用与所述基因座一一对应的扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，并由该扩增产物获得 所述基因座的基因型的步骤， 其中，混合精斑中DNA的Y-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的核苷酸序列； 所述差异Y-STR基因座的扩增引物为选自SEQ ID No. 1至SEQ ID No. 28的两条或多 条核苷酸序列； 所述常染色体STR基因座，以及性别决定基因座Amelogenin的扩增引物为序列表中 SEQ ID No. 29至SEQ ID No. 50的核苷酸序列。
【文档编号】C12Q1/68GK104232751SQ201410251298
【公开日】2014年12月24日 申请日期:2014年6月6日 优先权日:2014年6月6日
【发明者】李彩霞, 丰蕾, 涂政 申请人:公安部物证鉴定中心
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